科研产出
广东和广西火龙果溃疡病菌新暗色柱节孢遗传多样性分析
《热带作物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：广东和广西是我国火龙果主要产区,也是火龙果溃疡病的常发区,明确这些地区火龙果溃疡病菌新暗色柱节孢(Neoscytalidium dimidiatum)的遗传多样性对溃疡病的防治具有重要意义.本研究以主要来源于广西、广东的4个火龙果溃疡病菌地理群体为试验对象,利用ISSR分子标记扩增以获得其指纹图谱,并进一步分析溃疡病菌的遗传分化情况.供试的火龙果溃疡病菌经过8条ISSR引物扩增,得到203条条带,多态性位点为31.7%,菌株间遗传相似系数在0.7619~1.0000之间.在UPGMA聚类树上遗传相似系数为0.90时可分为3个类群,但遗传类群与地理分布上并无紧密联系.主成分分析结果显示,4个地理群体重叠性较高,不存在相对独立的地理种群.本研究证明我国火龙果溃疡病菌遗传多样性水平较低,各地之间存在频繁的菌源交流,该结果可为新暗色柱节孢的种群遗传结构和火龙果溃疡病病原菌监测的研究提供科学依据.
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葛根种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]对葛根种质资源进行遗传多样性分析,并构建分子身份证,为葛根种质鉴定提供参考依据.[方法]以收集来自不同地区的21份葛根种质为试验材料,采用变异系数、Shannon-Weaver多样性指数、聚类分析、ISSR引物多态性研究葛根种质资源遗传多样性,并构建分子身份证.[结果]21份葛根种质资源各遗传性状表现出丰富的多样性,其Shannon-Weaver多样性指数为0.381~1.844,平均值为1.166,其中主茎粗Shannon-Weaver多样性指数最大(1.844).葛根种质遗传性状变异系数范围为16.330%~55.714%,平均值为35.157%,其中,成熟叶片花纹变异系数最大(55.714%),其他遗传性状变异系数均大于15.000%.从48条ISSR引物中筛选出10条条带清晰,多态性较好的引物,其多态性比率为40.00%~100.00%;多态性信息含量值(PIC)、等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性(H')和Shannon's信息指数(I)分别为0.7043~0.8468、1.4000~2.0000、1.1135~1.4741、0.0776~0.2999、0.1276~0.4720,其平均值分别为 0.7800、1.7830、1.3514、0.2160、0.3353.说明所筛选的10条ISSR引物多态性检测效率较高,适合用于葛根种质资源的遗传多样性分析.聚类分析可将供试葛根种质分成3类,部分种质与地理来源存在一定关联性,存在不同地域种质互相引进或交流.按照ISSR引物中PIC值由大到小的顺序,筛选P6、P17和P42作为核心引物,构建葛根种质资源DNA分子身份证.[结论]21份葛根种质资源具有丰富的遗传多样性和较高杂合度,可作为今后葛根育种选育基础材料.筛选出的P6、P17和P42可作为核心引物,能有效区分21份葛根种质资源,并构建分子身份证.本研究为葛根种质资源区分和精准鉴定及葛根种质资源DNA分子身份证的构建提供了理论参考.
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基于ISSR与SCoT分子标记的赤苍藤种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了选育赤苍藤优良品种，本研究利用ISSR与SCoT分子标记技术对24份赤苍藤种质资源进行遗传多样性分析。结果表明，11条ISSR引物共扩增出91个条带，其中多态性带条73个，平均每条引物扩增多态性条带6.6个；10条SCoT引物共扩增出102个条带，其中多态性条带86个，平均每条引物扩增多态性条带8.6个。基于ISSR与SCoT标记的遗传相似系数的范围分别是0.560 4～0.857 1和0.529 4～0.882 4，说明赤苍藤种内具有较为丰富的遗传变异，其遗传多样性的表现与地理位置的相关性不显著。ISSR与SCoT标记分别在遗传相似系数0.72和0.69处可将24份赤苍藤种质聚为3类，两种分子标记的聚类结果基本相同。此外，在此研究基础上通过2条ISSR引物组合（UBC824, UBC827）和2条SCoT引物组合（SCoT-2, SCoT-27）分别构建了赤苍藤种质的DNA指纹图谱。本研究为赤苍藤种质资源的保护与利用、品种的鉴定与分类、选育与改良提供了理论依据。
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基于i PBS和ISSR分子标记的兜兰属同色组种质鉴定及遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】基于引物结合位点扩增（iPBS）和简单序列重复间DNA多态性（ISSR）分子标记对兜兰属同色组种质进行鉴定及遗传多样性分析，筛选出可靠的种质鉴定方法，为兜兰属种质鉴定、遗传多样性分析及分子育种提供科学依据。【方法】采用iPBS和ISSR分子标记对47份兜兰属同色组种质进行种质鉴定，并分析其亲缘关系和遗传多样性，挖掘可用于鉴别3个近缘种的分子标记。【结果】利用7条iPBS引物共扩增出117个位点，其中多态性位点100个，多态性比率为85.47%;47份供试种质的遗传相似系数为0.73～0.97；在遗传相似系数0.76处可将47份供试种质划分为三大类群，其中6份难鉴定种质与已知的文山兜兰聚为第Ⅱ类群，第Ⅰ类群包含了所有巨瓣兜兰种质，第Ⅲ类群包含了所有的同色兜兰种质。7条ISSR引物共扩增出115个位点，其中多态性位点111个，多态性比率为96.52%;47份供试种质的遗传相似系数为0.68～0.94，在遗传相似系数为0.73处可将47份供试种质划分为三大类群。第Ⅰ类群包括11个巨瓣兜兰种质，第Ⅱ类群包括表型难鉴定的6份种质及13个文山兜兰种质，第Ⅲ类群包括17个同色兜兰种质。iPBS和ISSR单独聚类结果和二者综合聚类分析结果略有差异，但种质聚类鉴定结果具有较高的一致性，均将47份兜兰属同色组种质分为三大类群，且6份难鉴定个体均与文山兜兰聚为一类，巨瓣兜兰和同色兜兰各自聚为一类。3个聚类分析结果均表明，文山兜兰与同色兜兰的亲缘关系较近，与巨瓣兜兰的亲缘关系较远。【结论】iPBS和ISSR分子标记均可用于兜兰属近缘种间的种质鉴定及遗传多样性分析，二者结合分析的方法可在DNA水平上更准确有效地鉴定易混淆种质，多种标记联合数据的聚类分析结果，能更全面客观地反映种质间的遗传多态性及亲缘关系。
关键词： 同色组兜兰 iPBS ISSR 种质鉴定 亲缘关系 遗传多样性
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基于ISSR标记分析油梨种质的遗传多样性
《农业研究与应用 》 2021
摘要：基于ISSR分子标记技术分析油梨种质遗传多样性和亲缘关系,旨在为油梨种质资源的合理利用提供科学依据。选用12条ISSR多态性引物对54份油梨种质的基因组DNA进行PCR扩增,利用Popgene 1.32、NTSYSpc 2.1软件计算遗传多样性参数、种质间的遗传相似系数以及UPGMA聚类分析。结果显示,筛选出的12条ISSR多态性引物共扩增出106条谱带,平均每条引物扩增8.08条多态性谱带,多态性位点比率PPB为91.83%,平均观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因多样性指数（H）、Shannon’s信息指数（I）以及多态性信息量（PIC）分别为1.89、1.47、0.28、0.43、0.63。油梨种质间的遗传相似系数在0.66～0.91之间,在遗传相似系数0.72处,可划分为5大类群,供试种质并不完全按照地理来源进行分类。54份油梨种质有较高的遗传多样性,遗传信息丰富,ISSR标记对其多态性检测有效性高,适用于其遗传多样性分析。
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基于ISSR标记的火龙果种质资源遗传多样性分析
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为明确火龙果种质资源的遗传多样性水平和亲缘关系,以69份火龙果核心种质为研究对象,采用ISSR分子标记进行火龙果遗传分析。结果表明:13条ISSR引物共检测到247个位点,其中多态性位点数为232个,多态性条带百分比（PPB）为93.93%,平均多态性信息含量（PIC）为0.9189;平均观测等位基因数（Na）为1.9084,有效等位基因数（Ne）为1.4606,期望杂合度（He）为0.2750,Nei氏基因多样性（H）为0.2616,香农信息指数（I）为0.4190。火龙果种质资源的遗传距离为0.0707～0.6741。基于遗传距离聚类分析结果,火龙果种质资源分为6大类群,第Ⅰ类群为红皮白肉类型,包括25份种质;第Ⅱ类群有19份种质,全部为红肉或紫红肉类型,包括红皮、青皮、橘黄皮类型;第Ⅲ类群包含类型较杂,包括粉肉、双色类型和水晶系列品种;第Ⅳ大类为黄皮白肉类型;第Ⅴ类和第Ⅵ类群均仅有一个种质,单独自聚一类。研究结果为火龙果种质资源的分类、保存与利用、遗传进化等研究及杂交组合选配提供理论指导和技术支持。
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桑毛色二孢根腐病菌遗传多样性的ISSR分析
《南方农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确来源于广西各地桑树根腐病病原菌可可毛色二孢(Lasiodiplodia theobromae Pat.)的遗传多样性特征,为桑树抗病育种提供参考依据。【方法】以从广西各桑树种植区采集、分离的44株L. theobromae菌株为材料,利用真菌基因组DNA提取试剂盒提取参试菌株的基因组DNA;从加拿大哥伦比亚大学公布的ISSR引物序列中随机选择60条引物先对8株菌株的DNA进行预扩增,选用扩增条带数量多、条带清晰的引物对所有参试菌株的DNA进行扩增,统计每条引物的扩增条带数形成0、1矩阵;利用NTSYSpc(Version 2.10e)计算不同菌株间的遗传相似系数,采用非加权组平均法构建系统发育聚类图,并进行聚类相关分析;利用PopGene(Version 1.32)分析不同地理来源和寄主来源菌株的遗传分化程度。【结果】ISSR分子标记结果显示,44株参试菌株(7个居群)的多态位点百分率在92.00%以上;7个居群的平均遗传一致度(IN)和平均遗传距离(D)分别为0.7363和0.3108;44株参试菌株的平均基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.3263和0.4841,均高于7个居群的平均值(0.1256和0.1796);对应的遗传分化系数(Gst)、基因流值(Nm)分别为0.6142和0.3141。【结论】广西地区桑毛色二孢根腐病菌菌株具有较高的多态性,菌株间的遗传多样性高于居群,遗传多样性与菌株的地理来源有关。
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晾晒烟种质资源ISSR指纹图谱构建及遗传变异分析
《福建农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】较为准确地揭示晾晒烟种质间的遗传关系,提高晾晒烟种质资源的利用率和育种效率。【方法】利用ISSR分子标记技术对36份晾晒烟种质资源进行遗传多样性分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出7条多态性好的引物,扩增出113个条带,其中91条多态性条带,多态性条带比例有80.5%;ISSR标记有效等位基因数(Ne)的平均值为1.64,Nei′s基因多样性指数(H)的平均值为0.37,Shannon′s信息指数(I)值的平均值为0.55,表明ISSR标记具有较高的多态性检测效率;聚类分析结果表明36份晾晒烟种质间的遗传相似性系数(GS)为0.74～0.91,品种间遗传多样性水平较低,以0.78处作为截值可以划分为5个组;数字指纹图谱可以较为有效地将供试材料进行区分。【结论】ISSR标记适合用于构建晾晒烟的DNA指纹图谱,可以为晾晒烟的品种鉴定提供科学依据。
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广西特色蕉类种质资源遗传多样性ISSR分析
《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：利用ISSR分子标记技术对广西特色蕉类种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明,从合成的35条ISSR引物中,筛选出13条条带清晰、多态性丰富及重复性好的引物,共扩增出96条条带,其中91条为多态性条带,平均多态性百分率达到93.69%。65份特色蕉类种质资源的遗传相似系数在0.479167~1.000000之间,平均为0.804726。聚类分析结果表明,在遗传相似系数为0.71时,可以将基因型为ABB的大蕉及粉蕉与其他基因型的蕉类种质资源进行区分;遗传相似系数在0.74时,能够把大蕉和粉蕉区分开来。而在相似系数为0.76附近,大蕉种质资源聚成3类,在0.92附近时,粉蕉种质资源可聚为4类。
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