科研产出
SSR分子标记检测出的花生类型内遗传变异(英文)
《遗传学报 》 2007 SCI 北大核心 CSCD
摘要：花生是我国重要的食用油和蛋白质来源作物,鉴定其DNA分子多态性对品种改良和资源评价具有重要的意义。从已公布的花生Genomic-SSR和EST-SSR引物中筛选出34对引物,用来分别鉴定花生4大类型各24份共96份品种资源的分子变异,其中龙生型资源全部来自广西,普通型资源中有11份从国外引进,有13份来自广西和国内其他省市,多粒型资源只有两份来自中国,其他22份分别来自印度、美国和非洲等地,珍珠豆型资源中有22份是来自中国各地的育成品种或农家品种,有2份来自国外。研究结果为:分别有10～16对SSR引物能在4大类型花生资源中扩增出多态性DNA片段;这些多态性SSR引物都具有多位点特性;首次为SSR分子标记设立了一个新的评价指标——区别指数,多态性SSR引物的区别指数最高达0.992;资源间的平均遗传距离,多粒型为0.59,普通型为0.48,珍珠豆型为0.38,龙生型为0.17。根据遗传距离采用最长距离法对4大类型花生资源分别进行了聚类分析,构建了资源间的遗传关系图,花生4大类型可进一步分成不同类群,资源间的亲缘关系与其来源相关。观察到PM15和PMc297的扩增产物具有类型特异性,PM15能在龙生型、普通型和多粒型花生资源中扩增出多态性条带,而在珍珠豆型花生中扩增条带完全相同,PMc297也有相似的扩增结果。由于在多粒型花生资源中检测出的遗传多样性最丰富,研究结果支持西班牙专家Krapovickas 1994年公布的花生栽培种分类系统。总之在花生4大类型内资源中能检测出丰富的SSR分子标记,开发出更多的SSR分子标记将能充分揭示花生分子水平的变异,从而使花生遗传图谱构建、分子标记辅助育种成为可能。
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中日韩三国薏苡种质资源遗传多样性研究
《广西农业科学 》 2006
摘要：将来自中国、日本和韩国的77份薏苡材料在广西南宁集中种植,依照国际植物遗传资源研究所(IPGR I)提供的农艺性状鉴定方法来进行田间观察鉴定和数据采集,对其遗传多样性进行比较分析。研究结果显示,三国薏苡种质在株高、叶面积、有效分蘖数、主茎直径等形态特征和生育特性上有着明显差异;日本和韩国的薏苡生长情况较差,明显不适应在我国南方生长,在生产上直接应用意义不大。研究结果可为薏苡的起源进化、遗传育种以及野生薏苡遗传资源的保护与可持续利用等深入研究提供理论依据。
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番茄栽培品种SSR标记和形态标记的遗传多样性分析
《热带亚热带植物学报 》 2006 北大核心 CSCD
摘要：比较了SSR标记和形态标记在研究番茄栽培品种遗传多样性上的应用。用7对SSR引物检测了11个番茄栽培品种的遗传多样性,共得到53条带,每一个位点上扩增出2-9条带,平均为6条;品种间遗传相似系数在0.39-0.84之间,平均遗传相似系数为0.60。根据11个形态学性状表型值计算的遗传相似系数在0.27-0.72之间,平均遗传相似系数0.58。用UPGMA进行聚类分析,SSR标记和形态标记都可依果肉颜色和果实大小将供试材料分组,即黄色和红色果肉,樱桃小番茄和大、中果形的混合型;两种方法对番茄栽培品种遗传多样性的评价相近。
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桂东南地区普通野生稻遗传多样性研究
《植物遗传资源学报 》 2005
摘要：利用25个微卫星位点对广西壮族自治区贺州、崇左、防城港3市8个居群301份普通野生稻材料的遗传多样性和遗传结构进行研究,结果表明桂东南地区普通野生稻遗传多样性丰富,平均等位基因数A=10.2400,有效等位基因数Ae=5.0221,平均期望杂合度He=0.7641,实际观察杂合度Ho=0.4840。根据固定指数(F=0.5653)计算出的异交率(t=0.2777)表明,普通野生稻的繁育系统是典型的混合繁育系统。对其遗传结构分析表明,总的遗传变异中有34.59%存在于居群间(Fst=0.3459)。进一步研究发现大多数居群偏离了Hardy-Weinberg平衡且杂合体不足(Fis=0.2680,Fit=0.4817)。最后根据各居群的遗传变异特点和遗传多样性比较,建议居群QT、YJ和TJ需要优先保护。
关键词： 普通野生稻 微卫星 遗传多样性 居群遗传结构 原生境保护
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23个广西本地芒果品种的ISSR分析(英文)
《分子植物育种 》 2005 CSCD
摘要：本研究对23个分别来自广西本地品种或广西选育的品种进行了SSR分析,并用15个芒果栽培品种印度(4个品种)、美国(3个品种)、缅甸(3个品种)、泰国(2个品种)及菲律宾、巴基斯坦和斯里兰卡(各1个品种)和2个芒果近源种冬芒(1个)和扁桃(1个)作为参照。从42个ISSR引物中筛选出9个多态性好的引物构建DNA指纹图谱来鉴别芒果的基因型。根据这9个引物获得的电泳图谱结果表明,本研究中所有供试品种能互相区分开来并表现出丰富的遗传多样性,说明ISSR是一种鉴定芒果品种(系)非常有效的方法。用74条多态性条带聚类分析作图发现所有供试的广西品种与秋芒、马切苏芒、象牙芒和爱文芒归为一个大类,而且广西本地芒果品种之间的亲缘关系较近。
关键词： 芒果 Mangifera indica ISSR 遗传多样性
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水稻纹枯病菌遗传差异的初步研究(英文)
《广西农业科学 》 2005
摘要：水稻纹枯病菌的遗传分化给病害的防治特别是抗病育种工作带来了很大的困难。为了确定水稻纹枯病菌的致病力分化与其遗传差异的相关性,对25个分离菌的致病力、可溶性蛋白电泳及由RAPD得到的DNA指纹图谱进行了分析。研究结果表明,不同菌株间存在明显的致病力分化。基于菌体的可溶性蛋白电泳及其聚类分析表明菌株的致病力分化与蛋白质谱带的多样性具有一定的相关性,但未达到显著相关水平;RAPD分析结果表明菌株间相似系数最高的达99%,最低的却只有47%,反映出该病原菌存在许多不同的遗传位点,蕴藏着很强的遗传变异潜能;此外,菌株在DNA水平上的差异与其可溶性蛋白分析反映的遗传差异具有一定程度的一致性。由此可见,水稻纹枯病菌的致病力分化与其遗传差异具有一定的相关性,反映出该病原菌的致病力分化是有遗传背景的。
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