科研产出
茉莉花开放授粉系遗传多样性分析及亲缘关系鉴定
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了分析茉莉花开放授粉系遗传多样性及鉴定其亲缘关系，本研究以包含29份茉莉花开放授粉系的45份素馨属种质资源为材料，采用iPBS分子标记技术对其遗传多样性进行分析，并鉴定开放授粉系亲本。结果表明：(1)从50条iPBS引物中筛选出7条扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物；(2)利用筛选出的引物对45份素馨属资源基因组DNA进行PCR扩增，获得129条清晰条带，其中多态性条带117条，多态性比率80%～100%，平均多态性比率89.87%;(3)采用NTSYS-pc 2.1软件计算45份素馨属资源的平均观测等位基因数(Na)为1.898 7，平均有效等位基因数(Ne)为1.207 4，平均Nei's遗传多样性指数(He)为0.152 3，平均Shannon信息多样性指数(I)为0.224 4,45份素馨属资源表现出丰富的遗传多样性；(4)采用NTSYS-pc 2.1软件计算45份素馨属资源间的遗传相似系数为0.247 3～0.968 8，基于遗传相似系数进行UPGMA聚类，构建系统发育进化树，在相似系数0.54处将45份素馨属资源划分为3个类群；(5)素馨属种间资源的基因交流少，遗传差异较大，茉莉花与素馨属其他种较难发生自然杂交，但通过种内开放授粉可拓宽茉莉花遗传背景；(6) iPBS分子标记多态性高，重复性好，便于操作，能有效进行茉莉花开放授粉系的遗传多样性分析，供素馨属资源的鉴定、亲缘关系分析和分子辅助育种参考应用。本研究为茉莉花种质资源的鉴定和杂交育种提供参考依据。
关键词： 茉莉花 素馨属 iPBS分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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不同年代籼稻品种主要农艺性状和耐热性差异
《植物遗传资源学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：我国籼稻生产正面临着病虫害、热害等生物及非生物灾害的严峻挑战，发掘能够适应气候变化的优异籼稻种质资源是当前及未来籼稻育种和种业发展的迫切需求。以661份来源于我国南方各省不同年代的籼稻品种为试验材料，在广西南宁、贵州贵阳、湖北荆州、浙江杭州共4个异地环境下进行主要农艺性状的鉴定评价，并在人工培养箱进行苗期耐热性鉴定评价。结果表明，在异地环境下籼稻主要农艺性状有明显的表型差异，纬度较高的荆州和杭州鉴定点的籼稻单株产量高于纬度相对低的贵阳和南宁鉴定点；贵阳鉴定点的海拔明显高于其他鉴定点、夏季温度低于其他鉴定点，因此与其他鉴定点相比，抽穗天数、结实率、千粒重和谷粒宽有所增加，但株高、穗长、穗数和单株产量下降。在异地环境条件下，穗数、穗长、千粒重、谷粒长和谷粒宽的表型值相对较稳定，其次为抽穗天数、株高、结实率和单株产量，而穗粒数的稳定性较差；不同年代籼稻品种抽穗天数、株高、结实率和单株产量的稳定性系数总体随育种年代的推进而减小，即随着育种年代的递进，选育品种的生态适应能力逐渐提高。不同年代籼稻品种的表型比较表明，随着育种年代推进，穗粒数、单株产量、谷粒长、谷粒长宽比和幼苗存活率显著升高，穗数、千粒重、谷粒宽、幼苗赤枯度和叶绿素降低率显著降低，说明籼稻品种的表型性状总体向着大穗、多粒、长粒、高产和耐热方向发展。聚类分析表明，年代Ⅱ（1980年前育成的品种）和年代Ⅲ（1980-1999年期间育成的品种）的亲缘关系最近，其次年代Ⅰ（地方品种）与年代Ⅱ和年代Ⅲ的亲缘关系较近，年代Ⅳ（2000年后育成的品种）与其他3个年代品种间亲缘关系都较远。本研究还筛选出对异地环境下抽穗期和产量稳定性较好的桂华占、上村早、华南15、赣早籼45号等30份优异籼稻品种，这些品种对异地环境有较强的适应性，可作为亲本材料利用于未来的水稻育种中。
关键词： 籼稻 种质资源 农艺性状 苗期耐热性 稳定性 亲缘关系
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基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《中国瓜菜 》 2024
摘要：为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性，为新品种选育提供理论依据，采用目标起始密码子多态性标记（SCoT）技术，以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料，进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明，从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物；利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增，共扩增出238个位点信息，其中多态性位点227个，平均多态性位点百分比为95.38%；采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588～0.920之间，遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号，二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异，说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制，在相似系数0.735处，可将其划分为7个类群，说明61份黄瓜种质材料背景存在差异，但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT 12和SCoT 83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源，该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。
关键词： 黄瓜 SCoT分子标记 亲缘关系 遗传多样性 DNA指纹图谱
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基于SLAF-seq技术的石斛兰SNP标记开发及亲缘关系分析
《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：利用SNP标记技术对收集的石斛兰种质资源进行亲缘关系分析,为新品种选育亲本选择提供理论依据.以 60 份石斛兰种质资源为对象,用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对种质进行SNP标记开发及亲缘关系分析.通过对各样品的测序数据进行统计,共获得 157.34 Mb Clean Reads数据,各样本Reads数据在 576 195-5 359 710 之间.样本平均测序质量值Q30为 93.85%,平均GC含量为 40.16%.通过测序数据分析,共获得 1 337 217 个SLAF标签,标签的平均测序深度为 9.63×,其中具多态性的SLAF标签有1 049 638个.共开发得到11 248 186个群体SNP标记,每个样品的SNP 标记数目介于694 015-6 367 379之间,SNP标记完整度为 2.71%-24.89%,杂合率为 1.13%-5.74%.对群体SNP 过滤,共获得 31 499 个高度一致性的有效SNP 标记.利用筛选获得的SNP标记构建系统发育树,60 份石斛兰种质资源被分为 3 个亚群,这 3 个亚群分别包含材料为 Q1:3 份,Q2:21份,Q3:36 份.种质聚类结果与形态学分类结果基本一致.利用SLAF-seq技术能高效、精确地开发出适用于石斛兰种质遗传分析的SNP标记,开发的SNP标记可为石斛兰育种、遗传图谱构建、品种鉴定以及农艺性状的关联分析等研究提供分子基础.
关键词： 石斛兰 SLAF-seq SLAF标签 SNP标记 群体结构 发育树 亲缘关系 遗传分析
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基于i PBS和ISSR分子标记的兜兰属同色组种质鉴定及遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】基于引物结合位点扩增（iPBS）和简单序列重复间DNA多态性（ISSR）分子标记对兜兰属同色组种质进行鉴定及遗传多样性分析，筛选出可靠的种质鉴定方法，为兜兰属种质鉴定、遗传多样性分析及分子育种提供科学依据。【方法】采用iPBS和ISSR分子标记对47份兜兰属同色组种质进行种质鉴定，并分析其亲缘关系和遗传多样性，挖掘可用于鉴别3个近缘种的分子标记。【结果】利用7条iPBS引物共扩增出117个位点，其中多态性位点100个，多态性比率为85.47%;47份供试种质的遗传相似系数为0.73～0.97；在遗传相似系数0.76处可将47份供试种质划分为三大类群，其中6份难鉴定种质与已知的文山兜兰聚为第Ⅱ类群，第Ⅰ类群包含了所有巨瓣兜兰种质，第Ⅲ类群包含了所有的同色兜兰种质。7条ISSR引物共扩增出115个位点，其中多态性位点111个，多态性比率为96.52%;47份供试种质的遗传相似系数为0.68～0.94，在遗传相似系数为0.73处可将47份供试种质划分为三大类群。第Ⅰ类群包括11个巨瓣兜兰种质，第Ⅱ类群包括表型难鉴定的6份种质及13个文山兜兰种质，第Ⅲ类群包括17个同色兜兰种质。iPBS和ISSR单独聚类结果和二者综合聚类分析结果略有差异，但种质聚类鉴定结果具有较高的一致性，均将47份兜兰属同色组种质分为三大类群，且6份难鉴定个体均与文山兜兰聚为一类，巨瓣兜兰和同色兜兰各自聚为一类。3个聚类分析结果均表明，文山兜兰与同色兜兰的亲缘关系较近，与巨瓣兜兰的亲缘关系较远。【结论】iPBS和ISSR分子标记均可用于兜兰属近缘种间的种质鉴定及遗传多样性分析，二者结合分析的方法可在DNA水平上更准确有效地鉴定易混淆种质，多种标记联合数据的聚类分析结果，能更全面客观地反映种质间的遗传多态性及亲缘关系。
关键词： 同色组兜兰 iPBS ISSR 种质鉴定 亲缘关系 遗传多样性
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广西野生桃金娘亲缘关系的SRAP分析
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为弄清广西桃金娘资源的亲缘关系并发掘其优异种性,进行驯化或为将来选育种提供优异亲本材料。本研究采用SRAP技术对8份野生桃金娘种质进行亲缘关系分析,从99对SRAP引物中筛选出18对多态性好、分辨率高的引物。结果显示,18对引物共获得142条带,其中多态性位点107个,多态条带比率为75.35%,表明不同桃金娘种质基因型间存在着较丰富的遗传多样性;8份桃金娘种质的相似系数在0.680 0～0.795 0之间。在相似系数0.720 3处可将8份种质分为3大类群:类群1包括岑溪、昭平、容县;类群2包括北海、龙州小连城、桂林;类群3包括龙州大青山和龙州彬桥。试验材料中亲缘关系最近的是龙州大青山与龙州彬桥,亲缘关系最远的是桂林与岑溪。研究表明,SRAP分子标记可有效地应用于桃金娘种质亲缘关系研究,结果可为桃金娘种质的资源保存鉴定、亲本选配和遗传改良提供理论依据。
关键词： 桃金娘（Rhodomyrtus tomentosa） SRAP 亲缘关系
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基于SCoT分子标记的金花茶组植物种质资源遗传多样性分析
《中草药 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：目的利用SCoT分子标记技术分析27份金花茶组植物种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为金花茶组植物种质资源鉴定保护和开发利用提供理论依据。方法从100条SCoT引物中筛选出条带重复性好、多态性高的引物对供试材料进行PCR扩增,用NTsys 2.10e计算种质间的遗传相似系数,用非加权平均距离法（UPGMA）进行聚类分析,构建系统发育进化树。结果从100条SCoT引物中筛选出13条引物共扩增出566条条带,其中多态性条带549条,多态性比率为97%,平均每条SCoT引物扩增的总条带数和多态性条带数分别为43.54、42.23条,多态性比率为89.74%～100.00%,平均为96.82%;27份金花茶组植物种质间的遗传相似系数为0.367～0.754。聚类分析结果显示,遗传相似系数在0.480处可将27份金花茶种质划分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ 5组,遗传相似系数在0.511处第Ⅰ组被划分为a、b亚组,在0.517处第Ⅱ组被划分为c、d亚组,在0.508处第Ⅳ组被划分为e、f亚组。结论不同金花茶组植物种质间的遗传多样性丰富,SCoT分子标记多态性高,重复性好,可有效用于金花茶组植物种质资源遗传多样性分析,为金花茶组植物种质资源的鉴定保护、分子辅助育种和开发利用提供理论依据。
关键词： 金花茶组 种质资源 亲缘关系 遗传多样性 SCoT分子标记
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基于ISSR标记的火龙果种质资源遗传多样性分析
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为明确火龙果种质资源的遗传多样性水平和亲缘关系,以69份火龙果核心种质为研究对象,采用ISSR分子标记进行火龙果遗传分析。结果表明:13条ISSR引物共检测到247个位点,其中多态性位点数为232个,多态性条带百分比（PPB）为93.93%,平均多态性信息含量（PIC）为0.9189;平均观测等位基因数（Na）为1.9084,有效等位基因数（Ne）为1.4606,期望杂合度（He）为0.2750,Nei氏基因多样性（H）为0.2616,香农信息指数（I）为0.4190。火龙果种质资源的遗传距离为0.0707～0.6741。基于遗传距离聚类分析结果,火龙果种质资源分为6大类群,第Ⅰ类群为红皮白肉类型,包括25份种质;第Ⅱ类群有19份种质,全部为红肉或紫红肉类型,包括红皮、青皮、橘黄皮类型;第Ⅲ类群包含类型较杂,包括粉肉、双色类型和水晶系列品种;第Ⅳ大类为黄皮白肉类型;第Ⅴ类和第Ⅵ类群均仅有一个种质,单独自聚一类。研究结果为火龙果种质资源的分类、保存与利用、遗传进化等研究及杂交组合选配提供理论指导和技术支持。
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8个番荔枝栽培品种的花粉形态扫描电镜观察
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]明确番荔枝常见栽培品种的花粉形态特征及各品种间的亲缘关系,为番荔枝品种的分类鉴定研究提供理论依据.[方法]利用冷场发射扫描电镜技术,对8个番荔枝栽培品种的花粉形状、花粉大小及花粉外壁纹饰等形态特征进行观察,并进行主成分和聚类分析.[结果]供试番荔枝品种的花粉外部形态均呈长球形,花粉以四合体形式存在,辐射对称,极面观呈近圆形或菱形或四角形,赤面观呈近椭圆形,无萌发沟;各品种的花粉形状、花粉大小及花粉外壁网孔密度和大小均存在差异,其中,花粉大小为489.46~721.80μm2,极轴长为25.85~31.10μm,赤道轴长为18.93~23.15μm;花粉外壁均为网状饰纹,网孔直径为0.22~0.33μm,网孔密度为1.61~2.60 n/μm2.非洲骄傲、吉夫纳和绿钻品种间的花粉大小、网孔直径和网孔密度等性状指标差异不明显,但与其他供试品种间存在显著差异(P<0.05).花粉大小、极轴长、赤道轴长等特征指标与花朵的长度、花径宽度、鲜重等性状指标呈负相关.主成分分析结果显示,花粉外壁纹饰、花粉大小和花粉形状的差异可作为番荔枝品种分类的参考依据.而聚类分析结果显示,非洲骄傲、吉夫纳和绿钻3个品种的亲缘关系较接近,归为一类;其余栽培品种归为另一类.[结论]花粉形状、花粉大小和花粉壁纹饰等性状指标的差异可用作番荔枝品种(系)间亲缘关系及分类鉴定的孢子学依据.
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基于ISSR标记的卡特兰种质资源遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析卡特兰属(Cattleya)植物的遗传多样性并评价其亲缘关系,为卡特兰的品种鉴别、分类、遗传图谱构建及分子育种打下基础.[方法]采用ISSR分子标记技术,从100条ISSR引物中筛选出扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物对18份卡特兰种质资源进行PCR扩增,并利用GenAlEx 6.51计算各种间的遗传多样性参数;采用NTSYS 2.1的非加权算术平均聚类(UPGMA)法进行聚类分析.[结果]利用筛选出的6条引物对供试材料进行PCR扩增获得153条谱带,多态性条带比率达100%;遗传多样性参数中,平均观测等位基因数(Na)为2.000个,平均有效等位基因数(Ne)为1.207个,平均Nei's遗传多样性指数(He)为0.157,平均Shannon信息多样性指数(I)为0.281;卡特兰种质资源间的遗传相似系数在0.6514 ~0.8991;UPGMA聚类分析结果表明,在相似系数0.749处,可将18份卡特兰种质资源划分为6个类群.[结论]卡特兰种质资源间具有丰富的遗传多样性;UPGMA聚类分析结果与传统的形态学分类结果基本一致,18份卡特兰种质资源分别隶属于卡特亚属、波浪边亚属、类匈伯加亚属、镰刀形花亚属、因特美地亚属、藕茎花亚属和圈聚花兰属7个属.
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