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广西审定的华占系列杂交稻组合遗传多样性分析

《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:分析广西审定的华占系列杂交稻组合的遗传多样性,为培育华占优质组合提供理论依据。本研究利用农业行业标准(NY/T1433-2014)中公布的48对SSR引物,对广西审定的13个华占系列杂交水稻品种进行遗传多样性分析、DNA指纹图谱的构建及特异性标记的筛选。结果显示,广西、广东和湖南的等位基因数平均值分别为2.67、1.85和2.52,基因多样性指数平均值分别为1.809 7、1.629 5和1.888 5,Shannon’s指数平均值分别为0.652 3、0.472 0和0.682 2,PIC值>0.5占比分别为16.7%、16.7%和29.2%,说明广西和湖南的华占系列杂交稻组合遗传多样性较丰富,而广东的华占系列杂交稻组合遗传多样性水平较低。聚类分析表明,虽然部分组合遗传距离较为接近,但基本上可将广西、广东和湖南配制的组合区分开。本研究为选育华占优质组合、鉴定及分类提供了技术支撑。

关键词: 恢复系华占 遗传多样性 指纹图谱 特异性标记

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基于GC-IMS指纹图谱分析云南不同产地美味牛肝菌的挥发性成分

《中国食品学报 》 2024 EI 北大核心 CSCD

摘要:为探究不同产地美味牛肝菌挥发性风味物质的特征及差异,采用气相-离子迁移谱技术(GC-IMS)检测云南9个产地美味牛肝菌的挥发性风味物质并建立指纹图谱.结果表明:共鉴定出91种挥发性风味物质,主要包括醛类、酮类、酯类、醇类、酸类、烃类、醚类等,而不同产地的美味牛肝菌的挥发性风味物质存在差异.主成分分析结合聚类分析表明,通海(TH)和易门(YM)、昆明(KM)和嵩明(SM)的风味物质在统计学分析中表现出的差异最小,可能是地理位置与海拔高度形成的生态环境与气候条件综合作用的结果,具体成因有待分析.指纹图谱分析表明,1-辛烯-3-酮、乙醛、正戊醛、柠檬烯、乳酸乙酯、丙醛是牛肝菌的特征风味物质.本研究结果为美味牛肝菌的风味识别、产地鉴别奠定了理论基础.

关键词: 美味牛肝菌 气相-离子迁移谱 挥发性风味物质 主成分分析 聚类分析 指纹图谱

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葛根种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要:[目的]对葛根种质资源进行遗传多样性分析,并构建分子身份证,为葛根种质鉴定提供参考依据.[方法]以收集来自不同地区的21份葛根种质为试验材料,采用变异系数、Shannon-Weaver多样性指数、聚类分析、ISSR引物多态性研究葛根种质资源遗传多样性,并构建分子身份证.[结果]21份葛根种质资源各遗传性状表现出丰富的多样性,其Shannon-Weaver多样性指数为0.381~1.844,平均值为1.166,其中主茎粗Shannon-Weaver多样性指数最大(1.844).葛根种质遗传性状变异系数范围为16.330%~55.714%,平均值为35.157%,其中,成熟叶片花纹变异系数最大(55.714%),其他遗传性状变异系数均大于15.000%.从48条ISSR引物中筛选出10条条带清晰,多态性较好的引物,其多态性比率为40.00%~100.00%;多态性信息含量值(PIC)、等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性(H')和Shannon's信息指数(I)分别为0.7043~0.8468、1.4000~2.0000、1.1135~1.4741、0.0776~0.2999、0.1276~0.4720,其平均值分别为 0.7800、1.7830、1.3514、0.2160、0.3353.说明所筛选的10条ISSR引物多态性检测效率较高,适合用于葛根种质资源的遗传多样性分析.聚类分析可将供试葛根种质分成3类,部分种质与地理来源存在一定关联性,存在不同地域种质互相引进或交流.按照ISSR引物中PIC值由大到小的顺序,筛选P6、P17和P42作为核心引物,构建葛根种质资源DNA分子身份证.[结论]21份葛根种质资源具有丰富的遗传多样性和较高杂合度,可作为今后葛根育种选育基础材料.筛选出的P6、P17和P42可作为核心引物,能有效区分21份葛根种质资源,并构建分子身份证.本研究为葛根种质资源区分和精准鉴定及葛根种质资源DNA分子身份证的构建提供了理论参考.

关键词: 葛根 遗传性状 ISSR 指纹图谱 分子身份证

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基于ISSR与SCoT分子标记的赤苍藤种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD

摘要:为了选育赤苍藤优良品种,本研究利用ISSR与SCoT分子标记技术对24份赤苍藤种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,11条ISSR引物共扩增出91个条带,其中多态性带条73个,平均每条引物扩增多态性条带6.6个;10条SCoT引物共扩增出102个条带,其中多态性条带86个,平均每条引物扩增多态性条带8.6个。基于ISSR与SCoT标记的遗传相似系数的范围分别是0.560 4~0.857 1和0.529 4~0.882 4,说明赤苍藤种内具有较为丰富的遗传变异,其遗传多样性的表现与地理位置的相关性不显著。ISSR与SCoT标记分别在遗传相似系数0.72和0.69处可将24份赤苍藤种质聚为3类,两种分子标记的聚类结果基本相同。此外,在此研究基础上通过2条ISSR引物组合(UBC824, UBC827)和2条SCoT引物组合(SCoT-2, SCoT-27)分别构建了赤苍藤种质的DNA指纹图谱。本研究为赤苍藤种质资源的保护与利用、品种的鉴定与分类、选育与改良提供了理论依据。

关键词: 赤苍藤 ISSR SCoT 遗传多样性 指纹图谱

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晾晒烟种质资源ISSR指纹图谱构建及遗传变异分析

《福建农业学报 》 2019 北大核心 CSCD

摘要:【目的】较为准确地揭示晾晒烟种质间的遗传关系,提高晾晒烟种质资源的利用率和育种效率。【方法】利用ISSR分子标记技术对36份晾晒烟种质资源进行遗传多样性分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出7条多态性好的引物,扩增出113个条带,其中91条多态性条带,多态性条带比例有80.5%;ISSR标记有效等位基因数(Ne)的平均值为1.64,Nei′s基因多样性指数(H)的平均值为0.37,Shannon′s信息指数(I)值的平均值为0.55,表明ISSR标记具有较高的多态性检测效率;聚类分析结果表明36份晾晒烟种质间的遗传相似性系数(GS)为0.74~0.91,品种间遗传多样性水平较低,以0.78处作为截值可以划分为5个组;数字指纹图谱可以较为有效地将供试材料进行区分。【结论】ISSR标记适合用于构建晾晒烟的DNA指纹图谱,可以为晾晒烟的品种鉴定提供科学依据。

关键词: 晾晒烟 ISSR 指纹图谱 遗传多样性

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广西香蕉种质资源的SSR分析

《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要:研究广西特色香蕉种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为香蕉种质资源分类、品种鉴定和有效利用提供理论参考。采用13对SSR荧光标记引物,对收集到的24份广西主栽香蕉品种及特色种质资源进行扩增,采用毛细管电泳对其进行基因分型。共扩增得到131个等位基因,平均每对引物扩增得到10.1个等位基因。引物的多态性信息含量(PIC)为0.65~0.87,平均0.77。在相似系数0.85附近,24个香蕉品种划分为4个大类:第一大类包含栽培种的香牙蕉和广西各地区的野生近缘种,第二大类为大蕉,第三大类为粉蕉,第四大类为贡蕉。从收集到的野生资源中筛选与栽培种亲缘关系较近、且具有良好抗病性的品种,可作为抗病育种的中间材料,并从分子角度入手挖掘优良的基因加以应用。

关键词: 香蕉 SSR标记 指纹图谱 广西

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广西铁皮石斛HPLC指纹图谱研究

《天然产物研究与开发 》 2012 CSCD

摘要:采用HPLC法建立广西铁皮石斛提取液的指纹图谱,运用相似度评价药材质量。结果表明,在13个共有峰构成的铁皮石斛指纹图谱中,有11批药材相似度均在0.8以上,2批的相似度较差,未达到0.8,表明相似度大小与药材的产地有关。通过对栽培铁皮石斛不同部位药材的指纹图谱峰面积的比较,不提倡对药材提早采收。3批组织培养铁皮石斛的图谱相似度较低,说明培养到不同阶段的铁皮石斛材料组织培养物,其化学成分相差较大。

关键词: 铁皮石斛 HPLC 指纹图谱

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甘蔗属不同种及优良甘蔗栽培品种的SSR标记遗传多样性分析

《广西植物 》 2010 北大核心 CSCD

摘要:应用21对SSR引物与毛细管电泳技术,分析了52个甘蔗属品种的遗传多样性。共检测出327个SSR标记,平均每对引物检测15.6个。选择141个共显性标记构建SSR标记指纹图谱数据库,利用DNAMAN软件与UPGMA统计方法分析参试材料遗传多样性。DNAMAN软件同源分析显示,新台糖16号与台优1号之间的同源性最高(87%),品种之间最小的同源性为55%;利用UPGMA统计方法可把参试材料分成4个遗传相似性较高的类群。结果表明,SSR标记与毛细管技术的结合,可构建甘蔗种质资源SSR标记指纹图谱、分析甘蔗种质资源遗传多样性。聚类分析显示参试甘蔗材料的遗传基础相近,为了提高甘蔗选育种效率,应拓宽甘蔗选育种亲本的遗传基础,提高杂交栽培品种的抗虫、抗病等特性。

关键词: 简单重复序列(SSR) 甘蔗属 指纹图谱 毛细管电泳 遗传多样性

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甘蔗(Saccharum officinarum L.)品种遗传差异的AFLP分子标记分析

《作物学报 》 2004 北大核心 CSCD

摘要:采用AFLP技术 ,从 6 4对引物中筛选出 5对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物 ,对两个在生产上广泛推广应用的甘蔗品种的AFLP指纹图谱进行分析 ,计算了两品种间的遗传相似性和遗传距离。结果表明 ,5对引物在 2个甘蔗品种间均存在显著的差异 ,其中多态性位点占总扩增位点的 10 2 % ,区分率达 10 0 %。这对应用AFLP技术鉴定甘蔗品种的真伪提供了依据。本文还对甘蔗AFLP分析体系的关键技术以及银染的安全性和可靠性进行了讨论。

关键词: 甘蔗(Saccharum officinarum L.) AFLP 指纹图谱 品种鉴定

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用AFLP分子标记技术鉴别甘蔗(Saccharum of ficinarum L.)品种

《分子植物育种 》 2003 CSCD

摘要:本研究采用AFLP技术 ,从 6 4对引物中筛选出 5对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物 ,对两个在生产上广泛推广应用的甘蔗品种的AFLP指纹图谱进行分析 ,计算了两品种间的遗传相似性和遗传距离。结果表明 ,5对引物在 2个甘蔗品种间均存在显著的差异 ,其中多态性位点占总扩增位点的 10 2 % ,区分率达 10 0 %。研究结果对生产上应用AFLP技术鉴定甘蔗品种的真伪性提供了依据。本文对甘蔗AFLP分析体系的关键技术以及银染技术的安全性和可靠性进行了讨论。

关键词: 甘蔗(Saccharum of ficinarum L.) AFLP 指纹图谱 品种鉴定

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