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葛根种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

文献类型: 中文期刊

作者: 何文 1 ; 蔡兆琴 1 ; 陈会鲜 1 ; 张秀芬 1 ; 黄珍玲 1 ; 郭素云 1 ; 阮丽霞 1 ; 莫周美 1 ;

作者机构: 1.农业农村部龙州热带作物科学观测综合实验站/广西南亚热带农业科学研究所

关键词: 葛根;遗传性状;ISSR;指纹图谱;分子身份证

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2023 年 36 卷 011 期

页码: 2358-2366

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]对葛根种质资源进行遗传多样性分析,并构建分子身份证,为葛根种质鉴定提供参考依据.[方法]以收集来自不同地区的21份葛根种质为试验材料,采用变异系数、Shannon-Weaver多样性指数、聚类分析、ISSR引物多态性研究葛根种质资源遗传多样性,并构建分子身份证.[结果]21份葛根种质资源各遗传性状表现出丰富的多样性,其Shannon-Weaver多样性指数为0.381~1.844,平均值为1.166,其中主茎粗Shannon-Weaver多样性指数最大(1.844).葛根种质遗传性状变异系数范围为16.330%~55.714%,平均值为35.157%,其中,成熟叶片花纹变异系数最大(55.714%),其他遗传性状变异系数均大于15.000%.从48条ISSR引物中筛选出10条条带清晰,多态性较好的引物,其多态性比率为40.00%~100.00%;多态性信息含量值(PIC)、等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性(H')和Shannon's信息指数(I)分别为0.7043~0.8468、1.4000~2.0000、1.1135~1.4741、0.0776~0.2999、0.1276~0.4720,其平均值分别为 0.7800、1.7830、1.3514、0.2160、0.3353.说明所筛选的10条ISSR引物多态性检测效率较高,适合用于葛根种质资源的遗传多样性分析.聚类分析可将供试葛根种质分成3类,部分种质与地理来源存在一定关联性,存在不同地域种质互相引进或交流.按照ISSR引物中PIC值由大到小的顺序,筛选P6、P17和P42作为核心引物,构建葛根种质资源DNA分子身份证.[结论]21份葛根种质资源具有丰富的遗传多样性和较高杂合度,可作为今后葛根育种选育基础材料.筛选出的P6、P17和P42可作为核心引物,能有效区分21份葛根种质资源,并构建分子身份证.本研究为葛根种质资源区分和精准鉴定及葛根种质资源DNA分子身份证的构建提供了理论参考.

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