科研产出
解淀粉芽胞杆菌YU-1对水稻纹枯病的防治作用
《植物保护 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本文旨在筛选对水稻纹枯病有生防作用的菌株,并初步探索其生防作用机理.收集水稻、甘蓝、黄瓜等不同植物根际土壤,采用稀释分离和对峙培养法筛选对水稻纹枯病菌Rhizoctonia solani Kühn有抑菌作用的菌株;通过离体接种防效、盆栽防效、抑菌谱、对水稻纹枯病菌菌核萌发及形成的抑制作用等方面评价其生防潜力,并对生防菌株进行鉴定.结果表明,从采集的37份根际土壤中共分离获得细菌297株,其中4株对纹枯病菌具有较好的拮抗作用,菌株YU-1对水稻纹枯病菌菌丝生长的抑制率达89.8%;对西瓜枯萎病菌、草莓灰霉病菌、番茄早疫病菌、油菜菌核病菌、小麦赤霉病菌菌丝生长的抑制率均在85%以上;对水稻纹枯病的离体和盆栽防效分别为73.1%和66.3%;对水稻纹枯病菌菌核萌发的抑菌率在92%以上;经生理生化和分子鉴定为解淀粉芽胞杆菌Bacillus amyloliquefaciens.由此可看出,菌株YU-1对水稻纹枯病的防治具有较强的应用价值,具有进一步开发成生物农药的潜力.
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金柑CDDP-PCR反应体系优化研究
《浙江农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：构建优化金柑CDDP-PCR反应体系并筛选适用于金柑CDDP-PCR分析的理想引物,为利用CDDP标记技术辅助种质鉴定以及分子育种等提供参考依据。以金柑基因组DNA为模板,采用正交优化试验设计方案,对dNTPs浓度、引物浓度、模板DNA用量、Mg~(2+)浓度、Taq DNA聚合酶浓度设计5因素4水平试验,采用极差分析法、方差分析法和Duncan多重比较法对试验结果进行分析。结果表明:利用供试的5个金柑品种验证试验效果,21条CDDP通用引物均可扩增出多态性条带。最佳反应体系为:dNTPs浓度为0.15 mmol·L~(-1),引物浓度为1.0μmol·L~(-1),模板DNA用量为120 ng,Mg~(2+)浓度为1.5 mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶浓度为0.25 U,剩余体积用ddH_2O补足至20μL。各因素对反应体系影响从大到小依次为dNTPs>引物>模板DNA>Mg~(2+)>Taq DNA聚合酶。
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螺螨酯和螺虫乙酯在覆膜金橘中的降解残留规律研究
《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为评价螺螨酯和螺虫乙酯在覆膜金橘中使用的安全性,研究了螺螨酯、螺虫乙酯及其代谢产物在覆膜金橘中的残留分析方法和残留动态规律,建立了金橘中螺螨酯、螺虫乙酯及其代谢产物的超高压液相色谱-串联质谱(UHPLC-MS/MS)检测方法。结果表明,在0.002～2.5mg/kg添加水平范围内,螺螨酯、螺虫乙酯及其4种代谢产物在金橘中的添加回收率为86.9%～101.2%,相对标准偏差为2.3%～6.8%,方法检出限为0.1～5.0μg/kg,定量限为0.5～1.0μg/kg。螺螨酯和螺虫乙酯母体在覆膜金橘中的消解符合一级动力学方程,消解半衰期分别为14.1 d和23.1 d。最终残留实验结果表明,按照推荐的施药剂量使用,施药2次后15 d收获,螺螨酯和螺虫乙酯在覆膜金橘中的残留量均低于最大残留限量值(均为0.5 mg/kg)。
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桂西南地区6个苹婆株系综合性状比较
《西南农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]比较桂西南地区苹婆株系的综合性状,为筛选优良苹婆株系和选育优良苹婆品种提供参考依据.[方法]观测桂西南地区6个优良苹婆株系(分别为NY2、LH2、SK14、SJ30、BJ32和BJ33)的开花结果习性、农艺性状、抗逆性及经济性状,并应用DTOPSIS法对其农艺性状及果实产量和品质等性状指标进行综合评价.[结果]不同苹婆株系间在开花结果习性、农艺性状、抗逆性及果实性状等方面存在一定差异.其中,单株产量较高的是SK14(14.86 kg)和BJ33(14.50 kg)株系,二者间无显著差异(P>0.05,下同),但均极显著高于NY2、LH2、SJ30和BJ32株系(P<0.01,下同),而NY2、LH2、SJ30和BJ32株系间差异不显著;SK14的单果重最重(65.3 g),极显著大于NY2、LH2和BJ32株系,显著大于SK14和SJ30株系(P<0.05,下同);BJ32的出种率最高(58.6%),极显著高于NY2、SK14和SJ30株系,显著高于BJ33株系;SK14的单种重最轻(5.90 g),极显著小于其他5个株系(5个株系间差异不显著);NY2的蛀荚率最低(5.2%),极显著低于SK14株系,显著低于LH2、BJ32和BJ33株系;SK14的淀粉含量最高(65.899%),显著高于NY2、LH2、SJ30和BJ32株系;BJ32的可溶性糖含量最高(27.496%),极显著高于NY2、LH2和BJ33株系,显著高于SK14和SJ30株系;SJ30的可溶性蛋白含量最高(11.808 mg/gFW),极显著高于BJ33株系,与NY2、LH2、SK14和BJ32株系无显著差异.DTOPSIS法综合评价结果表明,BJ33株系的得分最高,C_i值为0.8336,综合性状最优.[结论]BJ33株系树势强,产量较高,果实饱满,种仁大,出种率高,品质风味佳,综合评价最优,可作为优良苹婆品种进一步开发利用;单项性状表现优异的SK14、BJ32和NY2株系适宜作为遗传资源用于品种改良研究.
关键词： 苹婆 农艺性状 DTOPSIS法 综合评价 桂西南
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木薯叶芽和花芽的转录组差异分析
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本研究以木薯花芽与叶芽为材料,通过Illumina HiSeqTM4000测序平台对其进行转录组测序,结果获得高质量序列45 010 506个、碱基数13.46 Gb,GC含量在43.5%以上、比对效率在78%以上.筛选得到3 782个差异表达基因(DEGs),其中上调2 409个、下调1 373个.DEGs涉及的主要功能有一般功能预测,翻译,复制、重组与修复,信号传导机制,次生产物合成、运输与代谢,翻译后修饰、蛋白质周转和分子伴侣,氨基酸运输与代谢,碳水化合物运输与代谢.DEGs显著富集的KEGG通路主要有植物激素信号传导、苯丙烷类生物合成、淀粉和蔗糖代谢、苯丙氨酸代谢、氨基酸的生物合成和碳代谢.获得植物开花相关基因47个,其中39个上调表达、8个下调表达.研究结果在一定程度上解析了木薯花芽分化的分子机制,并为后续的深入研究提供了基础数据.
关键词： 木薯(Manihot esculenta) 转录组测序 花芽分化 开花基因
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杧果品种亲缘关系的CDDP分析
《浙江农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：利用保守DNA衍生多态性(CDDP)分子标记技术,对广西亚热带作物研究所保存的31个杧果品种进行遗传多样性分析,为杧果种质资源的鉴定及分子辅助育种提供理论依据.筛选出8条CDDP引物对供试的杧果品种进行PCR扩增,分析电泳图,并进行聚类分析和主成分分析.从31个杧果品种中共扩增出107条清晰条带,其中多态性条带(NPB)100条,多态性比率(PPB)达到93.57%.平均每条引物可扩增出13条带和12条多态性带.每个位点的平均等位基因数(N_a)、有效等位基因数(N_e)、Nei's基因多样性(H)、Shannon信息指数(I)分别为1.847 1、1.636 8、0.410 8、0.84,表明杧果品种间具有丰富的遗传多样性.供试杧果品种间相似性系数范围为0.620 6~0.920 8.UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数0.690 6处可以将供试杧果划分为7类,主成分分析结果与聚类分析结果基本一致,划分结果与杧果来源地无密切关系.筛选获得的CDDP引物对杧果种质资源有较高的多态性检测率,适用于资源鉴别及亲缘关系分析.
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中国莲PHT1家族成员的生物信息学分析
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以植物PHT1家族蛋白为研究对象,基于中国莲(Nelumbo nucifera)全基因组数据库,利用生物信息学方法发掘中国莲可能存在的PHT1家族成员,并对中国莲PHT1家族成员进行序列比对、系统进化、保守序列、跨膜结构、二级结构和亚细胞定位等分析.结果表明,从中国莲全基因组数据库中筛选获得4个PHT1蛋白,分别命名为:Nn PHT1:1、NnPHT1:2、NnPHT1:3、NnPHT1:4.它们在植物PHT1家族中属于GroupⅠ,均含有保守序列:GGDYPLSATIxSE.该序列具有11~12个跨膜区域,且保守序列位于第4个跨膜区域内,均定位于细胞质膜,且在细胞内侧第6和第7个跨膜区域之间均含有一个较大的细胞胞质内环结构;磷酸化位点和糖基化位点的数量范围分别在33~50个和4~9个;二级结构中α-螺旋和无规卷曲结构的数量总和均高于70%.研究结果展示了中国莲的PHT1家族成员的序列基本信息和结构特点,为深入研究中国莲的该家族成员基因及其编码蛋白的结构功能提供理论依据.
关键词： 中国莲(Nelumbo nucifera) 基因组 PHT1家族 磷转运蛋白 生物信息学
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不同季节凌云白毫绿茶的香气成分差异分析
《食品科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解凌云白毫绿茶的主要香气成分,同时探明不同季节凌云白毫绿茶的香气成分差异.通过动态顶空-气相色谱-质谱技术对春、夏、秋3季凌云白毫绿茶的香气成分进行定性定量测定,基于茶样中各香气成分的相对含量,通过偏最小二乘-判别分析(partial least square-discriminant analysis,PLS-DA)建立不同季节茶叶判别模型,然后找到对分类起关键作用的香气成分,最后通过绘制热图和层次聚类分析确定各关键香气成分在不同季节凌云白毫绿茶中的分布规律.结果表明,本研究共鉴定出37种化合物,其中醇类和醛类化合物数量较多;凌云白毫绿茶主要香气成分为芳樟醇、正戊醇、香叶醇、L-薄荷醇、异丁醛、异戊醛、壬醛、乙酸乙酯、二甲硫醚、吲哚.建立的PLS-DA模型可以将3个季节的茶样明显区分,且模型可靠;本研究最终鉴定出12种香气成分区分不同季节凌云白毫绿茶的关键化合物,分别为壬醛、β-紫罗兰酮、L-薄荷醇、3,5-辛二烯-2-酮、反-橙花叔醇、苯甲醇、正戊醇、十三烷、顺式-2-戊烯-1-醇、顺-茉莉酮、十四烷、叶醇.结合热图及12种香气成分的聚类分析,表明L-薄荷醇和 β-紫罗兰酮在秋茶中相对含量最高,是凌云白毫秋茶区别于春茶和夏茶的特征香气成分,主要表现为花香、果香、薄荷味;苯甲醇和正戊醇在春茶中相对含量较高,是凌云白毫春茶区别于夏茶和秋茶的特征香气成分,主要表现为果香、杏仁苦味;壬醛、3,5-辛二烯-2-酮、反-橙花叔醇在夏茶中相对含量最高,是夏茶的特征香气成分,香气主要为柑橘柠檬香、水果甜香.
关键词： 季节 凌云白毫绿茶 香气成分 动态顶空-气相色谱-质谱 偏最小二乘-判别分析
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红麻谷胱甘肽还原酶基因(HcGR)的克隆及盐胁迫下表达分析
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]克隆红麻谷胱甘肽还原酶基因(HcGR)并分析其组织表达特性及不同盐胁迫下的表达模式,为深入研究HcGR基因在响应盐胁迫的分子调控机制提供理论参考.[方法]基于红麻转录组测序结果,克隆HcGR基因,对其序列进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR检测HcGR基因在红麻不同组织及不同盐度胁迫[CK(0 mmol/L NaCl)、T1(50 mmol/L NaCl)、T2(100 mmol/L NaCl)和T3(200 mmol/L NaCl)]下的表达情况.[结果]克隆获得的HcGR基因开放阅读(ORF)长度为1698 bp,其编码蛋白相对分子量为60 kD,由555个氨基酸残基组成,理论等电点(pI)为8.46,为亲水性蛋白,定位于叶绿体;HcGR蛋白二级结构以无规则卷曲为主,以α-螺旋、延伸链和β-转角为辅,所占比例分别为44.14%、27.75%、22.16%和5.95%,其三级结构由无规则卷曲、α-螺旋和延伸链3种结构元件相互盘绕而成;该蛋白与榴莲GR蛋白亲缘关系较近.HcGR基因在红麻根、茎和叶中均有表达,且相对表达量存在显著差异(P<0.05,下同),相对表达量排序为叶>根>茎,表明HcGR基因具有明显的组织表达特异性.在红麻的根和叶中,HcGR基因相对表达量随NaCl胁迫浓度增加整体上呈先升高后降低的变化趋势,且均在T1处理下达峰值,显著高于CK、T2和T3处理.HcGR基因在茎中的相对表达量随NaCl胁迫浓度增加呈波动变化趋势,但T1、T2和T3处理均高于CK,其中T1和T3处理显著高于CK.[结论]HcGR基因在红麻根、茎和叶中的表达具有明显组织特异性,且可被不同浓度NaCl诱导响应盐胁迫信号,并通过上调各组织中的转录水平以提高抗盐胁迫能力,故推测该基因在红麻抗盐胁迫机制中发挥重要调控作用.
关键词： 红麻 谷胱甘肽还原酶(GR) 基因克隆 盐胁迫 实时荧光定量PCR 表达分析
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基于SNP分子标记的澳洲坚果种质遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了明确澳洲坚果品种的遗传多样性,本研究利用基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性技术对45份澳洲坚果种质的单核苷酸多态性(SNPs)位点进行了基因分型,分析其亲缘关系与遗传多样性.结果 表明,种质测序中SNPs数量有427 736个,插入或缺失(indels)数量有26 055个,SNPs中发生转换概率与发生颠换概率的比值ts/tv为0.77,1 st ALT为0.79;单一序列中SNPs占3.5%,ts/tv为0.71,indels占3.5%.群体结构分析将45份澳洲坚果种质分为4类群,类群分别用红色、荧光绿色、蓝色和紫色表示.4个类群间基因交流密切,可根据条带颜色的比例判断类群.第1类群有2份种质,第2类群有1份种质,第3类群有4份种质,第4类群有38份种质,利用UPGMA法得到的聚类结果,同样表明45份种质分为4个类群.澳洲坚果种质资源存在很多品系,本研究结果为澳洲坚果分子标记辅助育种提供科学依据.
关键词： 澳洲坚果 遗传多样性 单核苷酸多态性(SNP)
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