科研产出
红麻雄性不育细胞质相关的cSNP位点发掘
《中国农业大学学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：在前期已获得红麻atp9基因编码区的基础上,以红麻细胞质雄性不育系P3A、保持系和F1代为材料,随机选取不同材料的3个atp9独立gDNA克隆子进行测序和序列比对。结果显示:具有不育细胞质的不育系和F1代与具有可育细胞质的保持系在第290位点处存在碱基差异,具有不育细胞质的材料均为碱基T,而具有可育细胞质的材料在相应位点为碱基A;atp9基因第290位点处T/A碱基转换的cSNP位点经已知细胞质的红麻种质资源的进一步检测,同时结合这些资源的田间育性进行分析发现,红麻种质资源UG93-2MS-1、UG93-2MS-2、UG93-2MS-3、UG93-2-22、KN250、KN142、ZB90在第290位点处为碱基T,能扩增出319bp条带,在田间对应的育性除品种UG93-2-22为可育外,其余均为不育或半不育;而福红992在第290位点处为碱基A,未能扩增出319bp条带,在田间对应的育性为可育。因此,位于atp9基因的第290位点处的T/A碱基转换的cSNP位点与红麻不育细胞质相关或连锁,为红麻不育细胞质鉴定提供了新的检测手段。
全文链接
请求原文
基因差异表达技术cDNA-SCoT在植物上的研究应用
《农业生物技术学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCo T)分子标记是一种源于起始密码子ATG翻译起始位点保守区域来设计其侧翼单引物的标记技术。自从首次应用SCo T标记进行甘蔗(Saccharum officinarum)基因差异表达分析以来,该技术已被广泛应用于花生(Arachis hypogaea)、玉米(Zea mays)、铁皮石斛(Dendrobium officinale)、芒果(Mangifera indica)、西瓜(Citrullus lanatus)等植物的研究。本文介绍了c DNA-SCo T技术的原理、引物设计方法及特征,着重总结c DNA-SCo T技术体系筛选及其在抗病、抗寒、抗旱、遗传进化等方面的应用研究,以期为科研工作者在选择差异表达分析技术提供参考。
全文链接
请求原文
126份番茄材料的抗性基因分子标记检测
《中国蔬菜 》 2016 北大核心
摘要：利用分子标记技术,对56份大、中果型番茄进行烟草花叶病毒病抗性基因Tm-2a、番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty-1、Ty-2、Ty-3、叶霉病抗性基因Cf-9、晚疫病抗性基因Ph-3、枯萎病抗性基因I-2和根结线虫病抗性基因Mi-1 8个抗性基因的检测,对70份小果型番茄进行Tm-2a、Ty-1、Cf-9、I-2、Mi-1 5个抗性基因的检测。共获得含烟草花叶病毒病抗性基因Tm-2a的材料71份;在番茄黄化曲叶病毒病的3个抗性基因方面,含纯合抗性基因Ty-1的材料7份,杂合16份;含杂合抗性基因Ty-2的材料1份;含纯合抗性基因Ty-3的材料5份,杂合7份。真菌性病害方面,含叶霉病抗性基因Cf-9的材料101份;含纯合晚疫病抗性基因Ph-3的材料1份,杂合6份;含枯萎病抗性基因I-2的材料68份;含根结线虫病抗性基因Mi-1的材料45份。供试番茄材料中,DHG-27同时含有7个抗性基因;含有6个抗性基因的材料有5份,分别为:DHG-11、DHG-20、DHG-34、ZHG-8、HG-4;含有5个抗性基因的有HG-3、XHG-352份材料。
全文链接
请求原文
果蔗拔地拉及其芽变株系的SCoT、BPS和URP联合分子鉴定
《基因组学与应用生物学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：前期我们获得了果蔗拔地拉的4份自然芽变株系,本研究旨在揭示果蔗拔地拉及其自然芽变株系在DNA水平上的分子差异。综合采用基于单引物扩增反应的三种分子标记技术(SCoT,BPS和URP)的20条单引物对果蔗拔地拉及其自然芽变株系进行分子鉴定。结果表明:(1)在随机使用的20条单引物(3条SCoT标记单引物,5条BPS标记单引物和12条URP标记单引物)中,BPS9、URP6R和URP17R这三条单引物均扩增失败,未能扩增出任何条带,剩下的17条单引物总共扩增产生了89条条带,17条单引物中平均每条单引物扩增出5.24条条带;(2)3条SCoT标记单引物和5条BPS标记单引物均未能扩增产生出明显的可重复差异条带,只有URP标记单引物URP38F能扩增产生一条由亮度强弱及有/无同时存在引起的可重复差异条带,该条带大小约625 bp,该条单引物及其所产生的约625 bp大小的条带可用于果蔗拔地拉及其自然芽变株系的分子鉴定,能有效区分果蔗拔地拉及其自然芽变株系在DNA分子水平上显示出来的微小的遗传差异。
关键词： 甘蔗 果蔗拔地拉 芽变株系 分子鉴定 SCoT BPS URP 分子标记
全文链接
请求原文
利用辐射诱变及分子标记辅助筛选进行苦瓜种质创新
《南方农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】对苦瓜不同材料干种子进行辐射诱变,并利用分子标记对突变植株进行筛选,建立一套苦瓜种质创新和遗传改良的快速高效技术体系,为苦瓜遗传育种提供参考。【方法】以3个苦瓜资源MC1、MC42、MC52干种子为材料,利用60Co-γ射线进行不同辐射剂量(0、600、700、800、900、1200、1500 Gy)处理,调查其发芽率、出苗率、成苗率,以确定适宜辐射剂量;利用SRAP分子标记对诱变植株M2代突变单株进行筛选,并根据雌花率、农艺性状、抗病性等指标对雌性系连续多代进行田间定向选育,培育苦瓜雌性系。【结果】与对照(0 Gy)相比,经600~1500 Gy辐射处理后,不同苦瓜材料干种子的发芽率、出苗率及成苗率整体呈下降变化趋势;MC1、MC42和MC52干种子的半致死剂量分别为900、700和600 Gy,适宜苦瓜的辐射剂量为600~700 Gy,成苗率为确定辐照剂量的可靠敏感性测定指标。在M2代利用SRAP分子标记对18571个单株进行筛选,获得突变单株508株,其中纯雌单株116株,雌花率≥50%的强雌性单株162株;对获得的突变单株连续进行3代田间定向筛选,成功筛选获得8个综合性状优良的突变雌性系,其中MC1-M52株、MC42-M53株、MC52-M53株,均存在多个位点的DNA变异。【结论】选择适合剂量的60Co-γ射线进行辐射诱变,结合"直接PCR试剂盒+SRAP分子标记"对苦瓜M2代进行高通量突变单株筛选,并连续进行田间多代定向筛选,是创新苦瓜种质的高效便捷手段。
关键词： 苦瓜 60Co-γ射线 辐射剂量 突变单株 分子标记 定向选育
全文链接
请求原文
利用SRAP、ISSR、SSR标记绘制黄麻基因源分子指纹图谱
《作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以国内外引进保存的231份黄麻种质资源为材料,分别采用SRAP、ISSR、SSR分子标记和编程DNA指纹图谱分析软件,绘制黄麻遗传资源基因组DNA指纹图谱。结果表明,通过筛选出的35对SRAP引物对231份黄麻品种进行标记分析,获得96份黄麻品种DNA指纹图谱;11个ISSR多态性引物对96份材料进行DNA标记分析,获得45份黄麻品种DNA指纹图谱;49对SSR多态性引物对48份黄麻品种进行DNA标记分析,获得13份黄麻品种DNA指纹图谱,累计完成了154份黄麻品种基因组DNA分子指纹图谱绘制。每一个被识别的品种都具有其独特的分子"身份证"。其他77份地方品种因与部分品种遗传相似性过高,未能被识别,表明黄麻地方品种存在较为严重的同种异名现象。
全文链接
请求原文
SCoT分子标记技术在木薯遗传多样性分析中的应用
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：应用SCo T标记对不同来源的28份木薯种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:从36条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物对28份木薯材料进行PCR扩增。共扩增出171条带,其中多态性条带123条,平均每条引物扩增多态性条带6.5条,多态性条带比率为71.9%。经NTSYS-pc2.10e软件计算分析,28份木薯种质间遗传相似系数在0.631~0.930之间。利用UPGMA法进行聚类的结果显示:在系数0.68处,木薯材料分为2大类,品种BRA354单独成为一类;在系数为0.734处,28份木薯种质资源主要聚为5大类,聚类结果与材料来源有一定相关性。SCo T标记能在木薯种质间检测出一定程度的遗传多样性,可为木薯遗传育种提供新的技术支持。
全文链接
请求原文
几种基于PCR的分子标记在甘薯遗传多样性研究中的应用
《生物技术进展 》 2014
摘要：遗传多样性是甘薯品种遗传改良的基础。由于分子标记具有数量极大、不受环境及基因表达与否的限制、多为共显性、不影响生物性状表现等优点,现已在甘薯遗传多样性研究中得到广泛应用。本文比较了RAPD、AFLP、SSR、ISSR和SRAP等几种基于PCR的分子标记方法,分别从遗传差异和亲缘聚类分析两方面,对它们在甘薯遗传多样性研究中的应用进行了综述。对比分析表明ISSR是一种共显性、成本较低、重复性好、多态性较高且非常有发展前途的分子标记,并已经被广泛应用到甘薯遗传多样性、物种亲缘关系、系统分类和辅助育种研究中。
全文链接
请求原文
贵港最大面积原生地新收集普通野生稻分子鉴定评价
《中国农学通报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为了对来自贵港市最大面积原生地新收集普通野生稻资源进行遗传多样性分析,并在此基础上进一步对居群内的个体进行区分。选择分布于水稻染色体组的25对微卫星(SSR)引物对来自贵港的349份材料进行多样分析和遗传结构研究。结果表明,所有个体平均等位基因数A=6,有效等位基因数Ae=2.23,期望杂合度He=0.44,实际杂合度Ho=0.40,香农指数I=0.88。该居群可分为4个亚群结构,并且90%以上个体可以得到区分。该群体遗传多样性丰富,SSR分子标记可以简单有效的区分群体内的大部分个体,提高了保护效率。
