科研产出
水稻粒长粒重主效基因GS3的功能标记开发与利用
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】开发控制水稻粒长和粒重的主效基因GS3的功能标记,并用于对广西晚稻主栽亲本美B的粒长改良,以期获得粒长增加的优良水稻亲本材料。【方法】根据短粒杂交稻亲本美B与长粒亲本宜香B在GS3基因序列的差异,开发GS3基因的功能分子标记M-GS3。利用宜香B为供体亲本,美B为受体亲本和轮回亲本,进行杂交和回交。在利用标记M-GS3对24份水稻亲本及BC_2F_7群体材料进行了基因分型检测,并对它们的粒长进行了测量。【结果】利用M-GS3对24份水稻亲本材料进行检测,发现在11份材料中含有GS3长粒等位基因,其余13份水稻亲本为GS3短粒等位基因,与24份水稻亲本的粒长表型一致。根据美B和宜香B的BC_2F_7群体材料基因分型的结果及粒长表型鉴定,筛选到10株农艺性状与美B接近,粒长大于9.5 mm的株系,其千粒重、粒长和长宽比均显著高于美B,而株高、有效穗数、穗长和结实率等性状与美B接近。【结论】标记M-GS3能有效检测出水稻亲本材料及育种群体中的GS3长粒等位基因。利用GS3基因进行水稻粒长改良,能有效提高被改良材料的粒长和千粒重。
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基于PARMS技术的水稻粒形基因GW8分子标记的开发
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】开发水稻粒宽调控基因GW8的荧光分子标记,为快速、准确鉴定其基因型提供技术支持。【方法】通过与宽粒亲本GW8基因序列进行比对可知,窄粒杂交稻亲本美B的GW8基因序列在第二内含子有2个碱基缺失差异的特性之一,据此结合五引物扩增受阻突变体系技术,建立GW8基因荧光分子标记PM-GW8。【结果】利用荧光分子标记PM-GW8对42份籼稻亲本材料进行鉴定,仅在美B中检测到有2个碱基缺失的荧光信号。对亲本材料的谷粒宽度进行测量,其中美B的粒宽相对其他品种较窄,验证了该分子标记检测GW8的基因型与粒宽表型相符合。【结论】GW8荧光分子标记PM-GW8能快速检测水稻是否存在2个碱基缺失的GW8基因,为利用分子标记辅助选择改良水稻粒宽提供高效、可靠的基因分型技术。
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罗汉果性别相关的SCAR标记筛选
《北方园艺 》 2019 北大核心
摘要：以罗汉果雌雄单株各30份为试材,采用随机引物筛选法,筛选与罗汉果性别相关的RAPD标记,并根据特异片段的测序结果,将RAPD标记转化为特异性和稳定性更好的SCAR标记,以期为罗汉果的性别早期鉴定和分子辅助育种研究提供参考依据。结果表明:在330条随机引物中获得了分别与罗汉果雌性和雄性相关的RAPD引物S2124和S343。根据特异序列测序结果,对雌性特异带S2124-1K和雄性特异带S343-1.4K各自设计并合成了2对SCAR引物,经验证,SCAR引物SC2124-1K-14在62℃和SC2124-1K-8在56℃均可扩增出1 019bp的雌性特异带,SC343-1.4K-12在64℃和SC343-1.4K-4在56℃均可扩增出1 373bp的雄性特异带。这些特异的SCAR标记具有较好的应用价值,可为罗汉果的性别早期鉴定提供分子依据。
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两性花毛葡萄野酿2号芽变株系Y137的鉴定及评价
《南方农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴定评价毛葡萄品种野酿2号的芽变株系Y137,为两性花毛葡萄优良新品种(系)提供亲本材料。【方法】对野酿2号芽变株系Y137进行形态学特征、生物学特性、果实品质特性等方面的观察及测定,以野酿2号为对照进行对比分析;并利用ISSR分子标记对芽变株系Y137进行遗传变异分析。【结果】芽变株系Y137在形态学特征、生物学特性、果实品质特性等方面与野酿2号存在明显差异:芽变株系Y137幼果为圆形,野酿2号幼果为椭圆形;芽变株系Y137成熟期比野酿2号提早7～10 d;芽变株系Y137可溶性总糖含量和糖酸比分别比野酿2号提高66.40%和90.64%,可溶性固形物含量比野酿2号提高15.5%。筛选出的9条引物共扩增出57条条带,多态性条带为7条,多态性比例为12.28%,遗传相似系数为0.8772,说明芽变株系Y137与野酿2号的基因组DNA存在差异,但遗传背景相似度较高。【结论】芽变株系Y137部分果实品质指标优于野酿2号,初步判定其为野酿2号的优良芽变,可作为毛葡萄新品种选育及品种改良的亲本材料。
关键词： 毛葡萄 野酿2号 突变株系Y137 分子标记 鉴定 果实 性状 特性
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基于PARMS技术的抗稻瘟病基因Pigm分子标记的开发
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】建立抗稻瘟病基因Pigm的荧光分子标记,为抗稻瘟病水稻品种分子育种提供简便、可靠的基因分型检测方法。【方法】利用抗稻瘟病基因Pigm基因序列与其等位基因Pi2、Pi9及感病品种日本晴中等位基因序列差异,结合PARMS技术(Penta-primer amplification refractory mutation system),建立Pigm基因的荧光分子标记。【结果】利用荧光分子标记PM-Pigm对48份水稻亲本材料进行检测,仅在谷梅4号中检测到Pigm荧光信号,并采用广西收集到的两个稻瘟病菌株ZB1和ZB13对48份水稻亲本进行了苗瘟抗性鉴定,验证分子标记有较强可靠性。【结论】Pigm荧光分子标记PM-Pigm能快速检测水稻是否包含Pigm抗性基因,为抗稻瘟病水稻分子标记辅助育种提供简便、可靠的基因筛选技术。
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栽培种西番莲完全型SSR的高通量鉴定及标记开发
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记。为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基因组中的完全型SSR进行高通量鉴定,获得13 104个完全型SSR。SSR核心序列结构主要为2～4个碱基,数量最多的为TA、AT、TC和AG,重复次数最高达到20次。利用生物信息学软件开发出12 934对SSR标记,并选取了其中20对标记在西番莲MTX与WJ10中进行了扩增特异性评估,结果显示多态率达60%。西番莲栽培种SSR标记的大量开发为西番莲种质资源的高效利用、品种的遗传改良及分子育种提供了技术支持。
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广西特色香稻地方品种香味及其香味基因型的鉴定
《南方农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴定广西地方香稻品种的香味及其香味基因型,为开发和利用广西香稻地方种质资源及选育优质特色香稻品种提供理论依据。【方法】将传统香味鉴定方法(KOH浸泡法和籽粒咀嚼法)与分子标记技术结合,对179份广西地方香稻种质资源的香味及其香味基因型进行鉴定。【结果】179份供试材料中,KOH浸泡法检测到具有香味的材料167份,籽粒咀嚼法检测到具有香味的材料124份。籽粒咀嚼法鉴定为香稻的品种中97.58%能用KOH浸泡法鉴定出香味,但KOH浸泡法鉴定为香稻的品种中仅72.46%能用籽粒咀嚼法鉴定出香味。利用分子标记法能检测到等位基因的有71份,占供试材料总数的39.66%,主要以InDel7和InDel4-5等位基因为主,其中仅1份检测到InDel2等位基因,40份检测到InDel7等位基因,37份检测到InDel4-5等位基因,未检测到InDel13等位基因,但有7份同时检测到InDel7等位基因和InDel4-5等位基因。71份能检测到等位基因的材料中有69份被籽粒咀嚼法和/或KOH浸泡法鉴定为香稻品种,正确率达97.18%。在籽粒咀嚼法和KOH浸泡法均鉴定为香稻的121个品种中,香味表型明确,但仅有55个品种能检测到等位基因,检出率为45.45%。来自百色市的供试材料中能检测到等位基因的品种占该市香稻品种总数的53.19%,含有InDel2、InDel7和InDel4-5等位基因型,但以Indel7等位基因型为主;来自河池市的供试材料中能检测到等位基因品种占该市香稻品种总数的比例最高,达64.10%,但只检测到2种基因型,以Indel4-5等位基因型为主;柳州市及其他市能检测到等位基因的比例远低于百色市和河池市。【结论】广西香稻地方品种具有较强的地域特色,不同地区的香稻香味等位基因存在明显差异,且可能存在已报道的等位基因之外的香味基因或香味等位基因,仅用4个已报道的等位基因不足以检测出全部的香稻品种,应将分子标记法与传统鉴定方法相结合,才可更准确鉴定出香稻品种。
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花生LTR和MITE转座子及其分子标记开发利用研究进展
《分子植物育种 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：花生是世界上最重要的油料作物和经济作物之一,但其遗传基础狭窄,分子标记严重不足,严重制约了其分子育种进程。而LTR反转录转座子和MITE转座子广泛分布于植物基因组中,具有拷贝数丰富和插入位点多态性等特点,非常适合用来开发分子标记。另外,一系列研究结果表明,转座子分子标记揭示栽培种花生的DNA多态性要明显高于SSR分子标记,展示了其潜在的应用前景。鉴于此,本研究对花生LTR反转录转座子和MITE转座子的分离及其分子标记开发利用研究进展进行了系统整理和归纳,旨在理清思路,了解国内外研究现状,为紧接下来的花生LTR反转录转座子和MITE转座子的分子标记开发利用研究奠定坚实的基础。
关键词： 花生 LTR反转录转座子 MITE转座子 分子标记 转座子
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