科研产出
荸荠种质资源品种遗传多样性ISSR分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为揭示不同荸荠栽培品种的遗传多样性,利用ISSR分子标记技术对24个荸荠品种的亲缘关系进行分析。结果表明,从100条ISSR引物中筛选出适合荸荠种质分析的11条ISSR引物,共扩增出86条带,平均每条引物扩增出7.8条带,多态性为69条带,多态性比例为80.3%。供试的24份荸荠品种两两之间的遗传距离值在0.0909-0.6071之间,平均值为0.3493。UPGMA法聚类结果表明24个荸荠品种在遗传距离0.34处可分为五类。24个荸荠品种在ISSR分析中亲缘关系较近,其遗传基础相对较狭窄,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异。
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菜心种质资源遗传多样性的SCoT分析
《南方农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用SCo T标记分析菜心种质资源的遗传多样性,为其分类和利用提供理论依据。【方法】搜集熟期和株色各异的33份菜心种质资源,利用筛选的12条SCo T引物对其进行遗传多样性分析。【结果】12条引物从33份菜心共扩增出83条带,引物多态性百分率变化范围为2.63%~57.89%,平均多态性百分率为36.00%;每条引物多态性条带变化范围为4~9条,平均3.4条;扩增片段大小为500~1500 bp。观察等位基因数(Na)为1.065,有效等位基因数(Ne)为1.254,Shannon’s信息多样性指数(I)为0.217,期望杂合度(He)为0.149,平均Nei’s遗传距离为0.428。AMOVA分析发现,81%的变异来源于品种内,19%的变异来源于品种间。聚类分析结果表明,在Nei’s遗传距离0.24处可将33份菜心分成两大类,第一类包括14个早熟品种、2个中熟和1个晚熟品种;第二类包括10个中晚熟品种和6个早熟品种。【结论】SCo T标记的分类结果与熟期分类结果较一致,多数菜心品种可根据熟期和SCo T标记归类;SCo T标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,可用于菜心遗传多样性研究的初步批量检测。
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48份玉米种质的耐旱性鉴定与评价
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴定48玉米种质资源耐旱性,为玉米耐旱品种选育及种质材料创新提供参考。【方法】在防雨大棚条件下于玉米喇叭期进行35 d的自然干旱处理,调查48份玉米自交系在正常供水和干旱胁迫下的果穗性状、植株性状及产量;以产量抗旱系数(DC)、产量抗旱指数(DI)、产量抗旱隶属度(SV)为评价指标,结合主成分分析对玉米种质耐旱性进行综合评价和聚类分析。【结果】在干旱胁迫下,48份玉米自交系的平均株高、穗位高、叶面积、茎粗、穗长、穗粗、穗行数和行粒数分别比正常供水条件下降低14.8%、11.7%、6.4%、9.0%、12.0%、2.5%、4.6%和16.6%,产量降幅为11.0%~59.8%。运用DC、DI和SV进行综合评价,筛选获得较耐旱自交系15个,不耐旱自交系11个。各抗旱性评价参数与玉米种质的产量、行粒数、穗长和穗粗等性状的相关性较明显,与株高、穗位高、叶绿素SPAD值、叶面积、茎粗和百粒重等相关性较低。主成分分析结果表明,DI、SV、产量、行粒数、DC和穗长等是玉米自交系抗旱性评价的重要指标;以上述参数进行聚类分析,结果表明,可将48份玉米种质聚为四大类:第Ⅰ类有10份材料,表现较耐旱;第Ⅱ类可细分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类包含11份材料,第Ⅱ-2亚类包含14份材料,其中第Ⅱ-2亚类中有5份自交系也较耐旱;第Ⅲ类包含1份材料,不抗旱;第Ⅳ类包含12份材料,较不耐旱。【结论】综合运用DC、DI和SV等评价参数并结合主成分分析和聚类分析对玉米自交系的耐旱性进行评价,结果较可靠;玉米产量、行粒数、穗长和穗粗等性状是生产中筛选耐旱种质的重要指标。
关键词： 玉米自交系 耐旱性 产量抗旱系数(DC) 产量抗旱指数(DI) 产量抗旱隶属度(SV) 综合评价 聚类分析
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东南亚水稻种质资源的光合特性比较及聚类分析
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探讨东南亚稻种资源的光合特性,并筛选出高光效基因资源,为广西高产水稻的遗传改良提供参考。【方法】对164份从东南亚国家引进的稻种资源进行光合性状测定,并通过聚类分析,按极高、中高、高、中、低等级别对所测得净光合速率进行分类,筛选并确定优质高效的种质材料。【结果】不同稻种资源间的净光合速率、气孔导度、胞间CO2浓度和蒸腾速率存在极显著差异。聚类分析将164份稻种资源划分为净光合速率极高、高、中高、中、低、极低6个类群,其中净光合速率值接近或大于30.00μmol/m2·s的极高净光合速率材料共14份,占测试材料的8.5%。【结论】东南亚稻种资源中存在高光效种质资源,筛选出的14份极高光合速率稻种资源可作为水稻高光效育种的中间材料加以利用。
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淮山药种质资源主要农艺性状遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探讨我国不同地区淮山药种质资源农艺性状的遗传多样性、亲缘关系及分类特征,为淮山药品种选育及生产利用提供参考。【方法】对收集的44份淮山药种质资源的19个农艺性状进行调查,通过遗传多样性分析、聚类分析与主成分分析,探讨其遗传多样性、亲缘关系及分类特征。【结果】44份淮山药种质资源形态性状间具有较高的多样性。在12个质量性状中,遗传多样性指数最高的是叶形(1.53),其次是薯皮颜色(1.51);薯形的频率分布最高(93.18%),其次为薯肉颜色(90.91%)和茎蔓形状(81.82%)。在7个数量性状中,多样性指数最高的是薯块长度(1.89),其次是生育期(1.84)和薯块径粗(1.77);变异系数最大的是单株产量(79.25%),其次为薯块径粗(42.21%)和单株结薯数(35.62%),最小的为生育期(17.57%)。根据各农艺性状的遗传差异,可将44份淮山药种质聚为四大类群;第Ⅰ类群种质均来源于广西,可作为有增产潜力的加工型亲本材料;第Ⅱ类群种质主要来源于广西,可作为高产选育目标亲本;第Ⅲ类群种质主要来自南方地区,均是人工栽培的野生类型品种,为一般性亲本;第Ⅳ类群种质主要来源于北方省区的种质,可作为一般性早熟选育亲本。主成分分析结果表明,前6个主成分累计贡献率达83.73%,第一主成分反映高产株型综合因子,第二主成分反映加工株型因子,第三主成分反映植株结薯因子,第四、五、六主成分分别反映薯块、薯皮颜色和茎蔓颜色因子。【结论】我国淮山药主要地方栽培种质资源间农艺性状差异明显,具有丰富的遗传多样性,其亲缘关系呈现一定地域生态环境规律;南方地区在品种选育中应注重对第一、第二主成分的选择。
关键词： 淮山药 种质资源 遗传多样性 聚类分析 主成分分析
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芒果果实品质评价因子的选择
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】简化芒果品质评价因素,为制定芒果品质评价指标提供参考依据。【方法】采用主成分分析、系统聚类分析及合理—满意度多维价值理论的合并规则,对广西栽培的18个芒果品种的果形指数、硬度、可溶性固形物含量、可滴定酸含量、可溶性糖含量和风味等19个主要品质指标进行综合评价,筛选芒果果实品质简化评价因子。【结果】芒果的多个品质指标变量间存在相对独立性和密切相关性,主成分分析后提取出可溶性固形物和可溶性总糖含量特征向量较大、水分含量特征向量绝对值较大等7个主成分,系统聚类分析后19个品质指标聚类简化成糖酸比、果肉色泽(L*)、维生素C(Vc)、果实硬度等9个代表性指标,经合理—满意度多维价值理论合并规则综合评价,筛选出红芒6号、紫花芒、桂热82号、桂热120号和香芒5个品种为品质较优品种。【结论】主成分分析、系统聚类分析及合理—满意度多维价值理论的合并规则可用于简化芒果果实品质评价工作。
关键词： 芒果品种 果实品质 评价因子 主成分分析 聚类分析 合理—满意度多维价值理论
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中早熟马铃薯品种(系)遗传多样性ISSR分析
《南方农业学报 》 2014 CSCD
摘要：【目的】采用ISSR分子标记研究中早熟马铃薯品种(系)的亲缘关系及遗传多样性,为南方冬作区中早熟马铃薯育种亲本选择提供参考。【方法】利用筛选的8条ISSR引物,对33份广西各地应用的马铃薯品种(系)进行遗传多样性分析。【结果】8条引物共扩增出46条条带,其中有29条呈多态性,平均多态性带比率为63.0%。33份马铃薯品种(系)的遗传相似系数在0.63045~1.00000,平均相似系数为0.80967。聚类分析结果表明,在相似系数0.79000附近,33份马铃薯品种(系)可分为四大类,第一大类有4个品种(系),分别是DE03-34-6、JL03-786、中薯19号和中薯18号;第二大类仅有中薯6号;第三大类包括龙脊1号和DE03-79-1两个品种(系);余下的26份品种(系)聚为第四大类。在分类中,部分亲缘关系较近的品种如中薯13号和中薯14号、中薯18号和中薯19号可聚为较近的一类,说明ISSR分子标记能够正确地按马铃薯的亲缘关系进行分类。【结论】供试马铃薯品种(系)间存在较丰富的遗传多样性,可根据聚类分析结果中的遗传距离选择亲本,为南方冬作区中早熟马铃薯育种亲本的选择和杂种优势利用提供参考。
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西南地区新玉米自交系的配合力效应及其聚类分析
《中国种业 》 2014
摘要：以Mo17、丹340、昌7-2、齐319、CI44为父本作为测验种,11个西南地区新玉米自交系RP125、R08、TD1、RP128、绵715、遵优1-1、98-3、南202、临1、水1-6、德12为母本,采用NCⅡ设计55个组合,进行产量配合力分析。结果表明:16个玉米自交系的产量配合力差异显著,遵优1-1、绵715、R08和齐319、CI44的GCA较高;组合遵优1-1×CI44、遵优1-1×丹340、遵优1-1×昌7-2、绵715×CI44、临1×CI44、遵优1-1×Mo17、R08×CI44、绵715×齐319、R08×Mo17、RP128×CI44的配合力总效应较高,为强优势组合,其利用潜力较大。根据产量SCA进行聚类分析,16个自交系分为3类:RP125、RP128、临1、TD1为第Ⅰ类群;R08、绵715、遵优1-1为第Ⅱ类群;98-3、南202、水1-6、德12为第Ⅲ类群。自交系绵715、遵优1-1和丹340、CI44的GCA和SCA效应都非常高,具有比较好的的利用前景,与其他自交系进行组配,比较容易选育出高产的玉米杂交组合。
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金福菇菌株的酯酶同工酶分析
《基因组学与应用生物学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：本文采用酯酶同工酶分析和聚类分析技术,对15个金福菇菌株的遗传多样性和亲缘关系进行分析鉴定,以便为金福菇的遗传育种提供依据。试验结果表明:共检测到18条谱带,其中有2条谱带的分布频率为100%,是所有菌株的特征谱带;15个菌株共有14种酶带类型,不同菌株的酶带数在8条至12条之间。聚类分析结果表明,15个菌株间的遗传相似系数在0.33~1.00之间,在相似系数为0.62时,可将15个金福菇菌株划为3大类群。老挝金福菇TgLo菌株与国内金福菇的亲缘关系最远;同一菌株的不同分离株如Tg1.1与Tg1.2、Tg10.1、Tg10.2与Tg10.3间的遗传相似系数在0.94以上;菌株Tg3与Tg8,Tg12与Tg10.2或Tg10.3间的遗传相似系数也达到0.94,可认为是同物异名。上述结果表明,酯酶同工酶方法可有效应用于金福菇的菌株鉴定及亲缘关系分析。
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70份毛葡萄种质资源遗传多样性的SSR分析
《南方农业学报 》 2013 CSCD
摘要：【目的】利用SSR标记进行毛葡萄遗传多样性的分析,阐明毛葡萄种质的亲缘关系,为有效利用野生毛葡萄种质及挖掘优良基因提供参考。【方法】利用筛选的多态性SSR引物对70份毛葡萄进行SSR扩增,评价不同种质遗传多样性,并分析亲缘关系。【结果】从40对SSR引物中筛选出16对多态性引物,共扩增出123条带,每对引物可检测到等位位点数3~15个,多态率26.7%~100.0%。PopGene分析结果表明,毛葡萄种群Nei’s基因多样性平均指数为0.4412,多样性信息平均指数为0.6308,具有较高的遗传多样性。Nei’s相似性系数分析结果表明,70份毛葡萄种质的遗传相似系数在0.60~0.89。UPGMA聚类分析结果表明,在遗传相似系数0.61处,70份毛葡萄材料可分为3大类群:第一类包含两份毛葡萄材料,编号为70和91,均来自广西罗城县;第二类包含5份材料,编号为28、1、129、3和131,除131外,其余4份来自广西罗城县;其他63份归为第三类,其中50份为广西罗城县毛葡萄。【结论】广西罗城县毛葡萄具有丰富的遗传多样性,可为毛葡萄种质资源的利用和品种选育提供参考。
关键词： 毛葡萄 种质资源 SSR分析 聚类分析 遗传多样性
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