文献类型： 中文期刊

作者： 韦婉羚 ¹ ; 杨海霞 ¹ ; 何文 ¹ ; 李恒锐 ¹ ; 梁振华 ¹ ; 陈会鲜 ¹ ; 张秀芬 ¹ ; 蔡兆琴 ¹ ; 阮丽霞 ¹ ; 李天元 ¹ ; 兰秀 ¹ ; 黄珍玲 ¹ ; 朱艳梅 ² ;

作者机构： 1.广西南亚热带农业科学研究所

2.南宁师范大学广西地标作物大数据工程技术研究中心北部湾环境演变与资源利用教育部重点实验室广西地表过程与智能模拟重点实验室

关键词： 赤苍藤;转录组;次生代谢;苯丙素生物合成;后修饰酶

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 333-344

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获得赤苍藤的转录组信息特征,利用Illumina Novaseq 6000高通量测序平台对赤苍藤根、茎、叶进行了无参转录组测序分析。结果获得143 412个unigene,平均长度为542.04 bp,平均GC含量为48.66%。BLAST分析表明,分别有18 787 （13.10%）、28 669 （19.99%）、19 657 （13.71%）、32 934 （22.96%）、35 228（24.56%）、26 046 （18.16%）个unigene在Swiss-Prot、Nr、Pfam、GO、KEGG和eggNOG数据库中得到注释。利用DESeq筛选差异表达基因,其中叶和根间的差异基因有20 519个,根和茎间的差异基因有12 154个,而叶和茎间的差异基因有18 498个; KEGG富集分析发现,差异基因主要富集在糖基转移酶、植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢以及苯丙素生物合成等代谢途径。进一步分析参与赤苍藤有效成分生物合成相关基因发现,有96个差异基因参与苯丙素生物合成途径,且主要在茎部高表达。同时获得具有氧化/羟基化功能的CYP450基因132个,具有糖基化功能的糖基转移酶基因108个。该研究在无基因组参考的情况下,探讨了赤苍藤根、茎、叶的转录组信息特征,为后期赤苍藤基因功能鉴定、次生代谢途径解析及调控机制的研究提供参考。