科研产出
基于外壳蛋白基因的广西西番莲夜来香花叶病毒的遗传多样性分析
《中国南方果树 》 2025 北大核心
摘要：为明确夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV)在广西地区的发生情况和群体遗传特征,对采集自广西13个市西番莲种植基地的187份疑似感病的西番莲样品进行RT-PCR检测,并选取来自不同产区样品的外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行克隆和测序,分析其系统发育、遗传进化、种群结构等特征.结果表明,187份样品中162份检出TeMV,检出率为86.6%,获得22个TeMV CP基因序列(GenBank登录号OR786355~OR786369,PP544171~PP544177).相似性结果表明,22份西番莲TeMV分离物CP基因的核苷酸序列一致性为94.7%~100%,氨基酸序列一致性为95.7%~100%.结合GenBank下载的19条序列的系统发育分析表明,41条序列分为3个大分支,广西西番莲TeMV分离物属于Ⅰ组;不同国家或地区来源的分离物相互分离,且相同寄主来源的分离物亲缘关系最近.西番莲TeMV分离物CP基因序列无重组现象,进化的主要驱动力是负选择压力.不同群组间的遗传分化显著,基因交流频率低,易发生遗传漂变,群体处于扩张趋势.本研究是针对广西地区西番莲上TeMV遗传变异的首次报道,为广西西番莲TeMV防控提供参考.
关键词： 广西 西番莲 夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV) TeMV CP基因 遗传多样性 遗传变异
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粤北甘蔗野生种质资源采集与多样性分析
《华南农业大学学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】在粤北地区开展甘蔗野生种质资源调查与采集，分析种质资源遗传多样性，为甘蔗遗传育种提供优良亲本。【方法】种质资源调查采集按每隔30 km或海拔落差100 m取样1次，记录采集路线和地理信息，挖取地下根茎保存。对6个数量性状和20个质量性状进行测定，通过计算变异系数、遗传多样性指数及数量性状间的相关性进行综合评价。【结果】共采集到4个属4个种共82份甘蔗野生种质资源，其中，割手密Saccharum spontaneum 28份、河八王Narenga porphyrocoma 26份、斑茅Erianthus arundinaceum 24份、芒Miscanthus sinensis 4份。粤北地区甘蔗野生种质资源种间表型变异丰富，数量性状的变异系数为10.9%～44.5%，割手密的平均变异系数最大(30.6%)，其次是芒(30.3%)，河八王最小(28.1%)。叶长、叶宽、株高和茎径两两之间存在极显著正相关，锤度与其他性状均不存在显著相关性。质量性状的Shannon-Wiener多样性指数为0.000 0～1.222 7。主成分分析将6个数量性状提取出2个主成分，累计贡献率62.312%。聚类分析显示，割手密第Ⅰ类群的2023GSM054和第Ⅲ类群的2023GSM246、河八王第Ⅰ类群的2023HBW224和第Ⅳ类群的2023HBW032以及斑茅第Ⅰ类群的2023BM023和第Ⅱ类群的2023BM246共6份材料的产量性状和品质性状表现突出。【结论】本研究在粤北地区采集的甘蔗野生种质资源的表型性状具有丰富的遗传多样性，筛选出6份综合表现优异的种质，为甘蔗育种提供了优良的基因源。
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基于ISSR分子标记的金花菌遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于ISSR分子标记对不同地理来源的金花菌进行遗传多样性分析,为金花菌菌种资源的分类鉴定、评价及挖掘利用提供科学依据.[方法]利用ISSR分子标记对湖南益阳、陕西咸阳、广西横州和广西梧州4个不同地理来源的61株金花菌菌株进行遗传多样性分析;使用NSYSpc 2.10e计算不同菌株之间的遗传相似系数并进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析,使用PopGene 1.32计算遗传多样性相关参数.[结果]使用11条ISSR引物共扩增获得168个位点,其中多态性位点158个,多态性比例为94.0%.UPGMA聚类分析结果显示,61株金花菌菌株之间的遗传相似系数在0.48~1.00;当遗传相似系数为0.60时,61株金花菌菌株被分为5个类群,类群Ⅰ为冠突曲霉(Aspergillus cristatus),类群Ⅱ为谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri),类群Ⅲ为假灰绿曲霉(Aspergillus pseudoglaucus),类群Ⅳ为Aspergillus cibarius,类群Ⅴ为赤曲霉(Aspergillus ruber).4个地理群体的Nei's遗传一致度在0.7409~0.9967,平均值为0.8607;遗传距离在0.0033~0.3000,平均值为0.1560;其中,陕西咸阳群体与湖南益阳群体之间的遗传距离最小,Nei's遗传一致度最高,而广西梧州群体与湖南益阳群体之间的遗传距离最大,Nei's遗传一致度最低.61株金花菌菌株的平均Nei's基因多样性指数(H')为0.2622,平均Shannon's信息指数(I)为0.4082,群体间遗传分化系数为0.4228,群体基因流值为0.6825.[结论]金花菌菌株具有丰富的遗传多样性,ISSR类群划分与金花菌菌种分类具有一定关联,同一菌种的遗传多样性与地理来源之间不存在明显的相关性.
关键词： 金花菌 曲霉属 冠突曲霉 ISSR分子标记 遗传多样性
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广西西番莲产区东亚西番莲病毒的发生情况及其遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]调查广西西番莲产区东亚西番莲病毒(East Asian passiflora virus,EAPV)发生情况,分析病毒种群遗传结构特征,为明确该病毒在田间的流行规律及制定防控策略提供参考依据.[方法]从广西13个市的西番莲主产区采集187份疑似被EAPV感染的西番莲样品,利用RT-PCR和核苷酸序列比对分析对样品进行鉴定.选取具有地域代表性的EAPV阳性样本,基于完整的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列,分析其序列相似性、遗传多样性、遗传变异、种群结构等特征.[结果]经RT-PCR验证,共有132份西番莲样品为EAPV阳性,检出率为70.6%.从EAPV阳性样品中测序获得23株EAPV CP基因序列,上传至GenBank获得登录号.23株EAPV分离株的CP基因核苷酸序列和氨基酸序列相似性分别为80.9%~100.0%和83.4%~100.0%.系统发育进化树分析表明,23株EAPV分离株分别属于AO株系(8个分离株)和IB株系(15个分离株).IB株系CP蛋白编码区第87~95位核苷酸比AO株系多9个核苷酸.遗传差异分析结果显示,EAPV两个株系间遗传分化显著.基因交流结果显示,2个株系间基因交流频率低,株系间易发生遗传漂变.遗传多样性分析结果表明,AO株系和IB株系的基因进化主要受负选择压力,2个株系处于扩张趋势.[结论]EAPV在广西西番莲主产区发生普遍.本研究获得的23个EAPV分离株包含AO株系和IB株系.遗传漂变和负选择压力是影响EAPV遗传变异的重要机制.
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彩色花生种质资源遗传多样性综合评价
《花生学报 》 2025
摘要：花生是我国重要的油料作物和经济作物，产品约50%用于榨油，40%用于各种食用。彩色花生指具有黑色、红色、白色、彩斑等种皮颜色花生的统称，是高端的食用型花生，市场需求旺盛且种植效益较高。本文从国内外收集彩色花生种质资源158份，普通粉色花生种质资源50份，对种皮颜色、种子长度等10个性状进行表型鉴定。统计结果显示，各性状之间的变异系数范围在12.15%～35.14%之间，其中百仁质量、颜色指数、种子面积和面积比的变异系数较大，均在20%以上。遗传多样性指数范围为7.61～7.69,表明拥有丰富的遗传多样性。相关性分析结果显示，百仁质量与长、宽、面积、直径、周长、面积均呈显著正相关，相关系数在0.50～0.96之间。聚类分析将种质分为4个类群：Ⅰ和Ⅱ主要是小粒组，平均百仁质量分别为50.51 g和34.29 g; Ⅲ和Ⅳ主要是大粒组，平均百仁质量分别为68.24 g和84.66 g。主成分分析发现4个主成分累计贡献率达99.09%,第一主成分反映种子的大小和质量，第二主成分反映种子的形状，第三主成分反映种皮的颜色。以上研究阐明了彩色花生的种皮颜色及种子大小、形状等相关的性状，为下一步利用这些种质资源培育彩色新品种提供了基础数据。
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苹婆种质果实性状多样性分析与综合评价
《植物遗传资源学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：苹婆又名凤眼果、九层皮等,是药食两用坚果类植物.为有效保护和利用苹婆种质资源,本研究采用多样性分析、聚类分析、相关分析、主成分分析和逐步回归分析等方法对70份苹婆种质进行遗传多样性分析和综合评价.结果表明:13个性状变异系数介于7.80%~42.94%,单果重、单果种子总重、可溶性糖含量、可溶性蛋白含量和淀粉含量变异程度较大.遗传多样性指数介于1.57~2.04,其中种形指数(2.04)、淀粉含量(2.02)、种子纵径(2.01)、果实种子数(2.00)的多样性指数较高.聚类分析把供试材料划分为4个类群,其中类群Ⅱ的15份资源属于果实偏大、外观品质较好的种质类型,符合市场及选育需求.相关性分析表明,种子重量分别与果实纵径、单果重、单果种子总重、种子纵径、种子横径呈极显著正相关,出种率与果实横径呈极显著负相关,可溶性蛋白含量与可溶性糖含量呈极显著正相关.主成分分析表明,前4个主成分能代表13个果实性状的大部分信息,累计贡献率为74.46%.果实性状综合评价得分(F)介于-2.95~3.35,S009、S021、S011、S036、S028等种质位居前列,综合性状优良.逐步回归分析筛选出单果种子总重、种子重量、可溶性糖含量、种子横径4个性状指标,可作为综合评价苹婆果实性状的关键性指标.通过鉴定评价,筛选出果形大、淀粉含量高、可溶性糖和可溶性蛋白含量丰富的优异种质资源6份.
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130份薄皮甜瓜种质材料果实性状的遗传多样性分析评价
《中国瓜菜 》 2024
摘要：为研究薄皮甜瓜种质资源果实性状的遗传多样性，对从全国各地搜集到的130份薄皮甜瓜种质资源的17个果实相关性状进行变异分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析。变异分析结果表明，11个质量性状的多样性指数变化范围为0.14～2.03,6个数量性状的多样性指数变化范围为1.55～2.03,17个性状的平均遗传多样性指数为1.25；相关分析结果表明，薄皮甜瓜种质果实的多个数量性状之间呈极显著相关；主成分分析结果表明，17个性状可归纳为7个主成分，累积方差贡献率达80.21%；聚类分析结果表明，当欧式距离为51.34时，可以将供试材料分为两大类群。综上所述，130份薄皮甜瓜种质的果实性状遗传差异明显，具有新品种选育和改良的利用价值。
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基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《中国瓜菜 》 2024
摘要：为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性，为新品种选育提供理论依据，采用目标起始密码子多态性标记（SCoT）技术，以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料，进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明，从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物；利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增，共扩增出238个位点信息，其中多态性位点227个，平均多态性位点百分比为95.38%；采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588～0.920之间，遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号，二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异，说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制，在相似系数0.735处，可将其划分为7个类群，说明61份黄瓜种质材料背景存在差异，但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT 12和SCoT 83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源，该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。
关键词： 黄瓜 SCoT分子标记 亲缘关系 遗传多样性 DNA指纹图谱
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广西审定的华占系列杂交稻组合遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：分析广西审定的华占系列杂交稻组合的遗传多样性，为培育华占优质组合提供理论依据。本研究利用农业行业标准（NY/T1433-2014）中公布的48对SSR引物，对广西审定的13个华占系列杂交水稻品种进行遗传多样性分析、DNA指纹图谱的构建及特异性标记的筛选。结果显示，广西、广东和湖南的等位基因数平均值分别为2.67、1.85和2.52，基因多样性指数平均值分别为1.809 7、1.629 5和1.888 5,Shannon’s指数平均值分别为0.652 3、0.472 0和0.682 2,PIC值＞0.5占比分别为16.7%、16.7%和29.2%，说明广西和湖南的华占系列杂交稻组合遗传多样性较丰富，而广东的华占系列杂交稻组合遗传多样性水平较低。聚类分析表明，虽然部分组合遗传距离较为接近，但基本上可将广西、广东和湖南配制的组合区分开。本研究为选育华占优质组合、鉴定及分类提供了技术支撑。
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桂糖系列甘蔗种质表型性状的遗传多样性
《云南农业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析桂糖系列甘蔗种质的主要表型性状及其遗传多样性，为提高其杂交育种效率提供参考。【方法】调查和测定广西甘蔗种质资源田间保育的164份桂糖系列甘蔗种质资源的21个质量性状和7个数量性状，采用多样性指数、遗传变异、相关性分析和聚类分析法进行遗传多样性分析。【结果】21个质量性状的遗传多样性指数在0.386 6～1.977 6之间，平均值为0.921 7，以芽形最大，生长裂缝最小；7个数量性状的变异系数在7.11%～42.86%之间，平均值为27.11%。相关性分析表明：株高、茎径分别与单茎质量、蔗茎产量、糖产量呈极显著正相关；单茎质量、有效茎数分别与蔗茎产量、糖产量呈极显著正相关；蔗茎产量与糖产量呈极显著正相关。聚类分析表明：164份桂糖系列甘蔗种质可聚为6个类群，其中，第Ⅰ类群数量最多，综合性状表现优异；第Ⅱ类群平均茎径最大；第Ⅲ类群各性状均衡且有效茎数稍有优势；第Ⅳ类群平均株高最高；第Ⅴ类群平均锤度最高；第Ⅵ类群平均有效茎数最多。【结论】164份甘蔗种质的质量和数量性状变异较大，遗传多样性较丰富，不同类群甘蔗种质各具优点，在甘蔗育种过程中应根据育种目标选择杂交亲本。
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