科研产出
基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《中国瓜菜 》 2024
摘要：为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性，为新品种选育提供理论依据，采用目标起始密码子多态性标记（SCoT）技术，以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料，进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明，从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物；利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增，共扩增出238个位点信息，其中多态性位点227个，平均多态性位点百分比为95.38%；采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588～0.920之间，遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号，二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异，说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制，在相似系数0.735处，可将其划分为7个类群，说明61份黄瓜种质材料背景存在差异，但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT 12和SCoT 83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源，该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。
关键词： 黄瓜 SCoT分子标记 亲缘关系 遗传多样性 DNA指纹图谱
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广西审定的华占系列杂交稻组合遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：分析广西审定的华占系列杂交稻组合的遗传多样性，为培育华占优质组合提供理论依据。本研究利用农业行业标准（NY/T1433-2014）中公布的48对SSR引物，对广西审定的13个华占系列杂交水稻品种进行遗传多样性分析、DNA指纹图谱的构建及特异性标记的筛选。结果显示，广西、广东和湖南的等位基因数平均值分别为2.67、1.85和2.52，基因多样性指数平均值分别为1.809 7、1.629 5和1.888 5,Shannon’s指数平均值分别为0.652 3、0.472 0和0.682 2,PIC值＞0.5占比分别为16.7%、16.7%和29.2%，说明广西和湖南的华占系列杂交稻组合遗传多样性较丰富，而广东的华占系列杂交稻组合遗传多样性水平较低。聚类分析表明，虽然部分组合遗传距离较为接近，但基本上可将广西、广东和湖南配制的组合区分开。本研究为选育华占优质组合、鉴定及分类提供了技术支撑。
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桂糖系列甘蔗种质表型性状的遗传多样性
《云南农业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析桂糖系列甘蔗种质的主要表型性状及其遗传多样性，为提高其杂交育种效率提供参考。【方法】调查和测定广西甘蔗种质资源田间保育的164份桂糖系列甘蔗种质资源的21个质量性状和7个数量性状，采用多样性指数、遗传变异、相关性分析和聚类分析法进行遗传多样性分析。【结果】21个质量性状的遗传多样性指数在0.386 6～1.977 6之间，平均值为0.921 7，以芽形最大，生长裂缝最小；7个数量性状的变异系数在7.11%～42.86%之间，平均值为27.11%。相关性分析表明：株高、茎径分别与单茎质量、蔗茎产量、糖产量呈极显著正相关；单茎质量、有效茎数分别与蔗茎产量、糖产量呈极显著正相关；蔗茎产量与糖产量呈极显著正相关。聚类分析表明：164份桂糖系列甘蔗种质可聚为6个类群，其中，第Ⅰ类群数量最多，综合性状表现优异；第Ⅱ类群平均茎径最大；第Ⅲ类群各性状均衡且有效茎数稍有优势；第Ⅳ类群平均株高最高；第Ⅴ类群平均锤度最高；第Ⅵ类群平均有效茎数最多。【结论】164份甘蔗种质的质量和数量性状变异较大，遗传多样性较丰富，不同类群甘蔗种质各具优点，在甘蔗育种过程中应根据育种目标选择杂交亲本。
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不同培养基组分对“台农一号”杧花粉萌发和花粉管生长特性的影响
《中国南方果树 》 2024 北大核心
摘要：为筛选"台农一号"杧花粉体外培养最适培养基和培养时间,探讨不同培养基组分和培养时间对其花粉体外萌发及花粉管生长的影响,以15%蔗糖+25%聚乙二醇-4000+0.015%硼酸+0.03%钙+0.02%镁+0.01%钾为基础培养基,分别设置1、2、3、4、5、6 h培养,不同蔗糖、硼酸、聚乙二醇-4000、钙、镁、钾浓度梯度单因素及蔗糖、硼酸、聚乙二醇-40003个因素正交试验,统计比较不同处理的花粉萌发率和花粉管生长长度.结果表明,培养时间,培养基中蔗糖、聚乙二醇-4000、硼酸对花粉萌发及花粉管生长均有显著影响,而钙、镁、钾影响不显著.培养2~3 h即可统计花粉萌发率及测量花粉管长度.随着培养基中蔗糖、聚乙二醇-4000、硼酸浓度增加,花粉萌发率及花粉管长度均呈现先增加后降低的趋势,适宜浓度的3个组分能够促进花粉萌发及花粉管生长,浓度过高则起抑制作用.3个因素之间存在明显的互作效应,蔗糖与聚乙二醇-4000的互作效应突出.说明培养基中蔗糖、聚乙二醇-4000、硼酸是花粉体外萌发的必需成分,钙、镁、钾为非必需成分."台农一号"杧花粉体外萌发及花粉管生长的最适培养基为15%蔗糖+20%聚乙二醇-4000+0.015%硼酸+0.03%钙+0.02%镁+0.01%钾,适宜培养时间为3 h,此条件下花粉萌发率达到83.40%.
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广西药用野生稻重要农艺性状遗传多样性分析
《热带作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：药用野生稻具有抗病虫、抗逆境、高生物产量、高光效等优良特性，蕴藏有许多优良基因。本研究用广西所有药用野生稻分布点收集的代表性资源199份，对抽穗期、花药长度、粒宽、粒长与粒重5个重要农艺性状进行遗传多样性、主成分等分析。结果表明：广西药用野生稻具有丰富的遗传多样性，抽穗期、花药长度、粒宽、粒长和粒重的变异系数分别为9.12%、11.90%、3.39%、4.64%和6.24%，多样性指数分别为1.4878、2.0453、1.7727、1.1567和2.0379。主成分分析表明：第1、第2主成分主要与产量性状相关，累计贡献率达63.759%，第3、第4主成分特征值相近，贡献率分别为16.306%和15.542%，抽穗期与花药长度是影响的决定因子，主要反映植株的生长特征。7个地理居群按遗传多样性大小排序为：梧州市（1.6731）＞玉林市（1.5784）＞贵港市（1.5070）＞南宁市（1.3325）＞来宾市（1.2131）＞贺州市（0.9629）＞钦州市（0.3819），梧州市的多样性指数最高，表明梧州市是广西药用野生稻表型遗传多样性的中心。
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66个广西审定丝苗品种农艺和品质性状多样性鉴定与聚类分析
《中国稻米 》 2024
摘要：为了明确广西审定水稻丝苗品种的农艺和品质性状差异与趋同程度，选用2017—2023年广西审定的66个丝苗品种为材料，对18个主要农艺和品质性状进行鉴定、表型多样性分析和品种间聚类分析。结果表明，这66个品种农艺性状表型和品质性状多样性丰富；基于农艺性状表型和品质性状的品种间欧氏距离聚类，可分为5类，包含29个品种的类群农艺性状表型和品质性状表现趋同，此类群包含两系杂交稻品种、三系杂交稻品种和常规稻品种；两系杂交稻品种表型多样性最高，分布于各个类群中，常规稻最低，基本被聚在同一大类中。类群间农艺性状表型和品质性状差异明显，具有相同母本或相同父本的品种基本聚归同类，品种间欧氏距离短。育种组配间会出现亲缘关系较远、农艺和品质性状接近的趋同情况。结果可为广西丝苗型水稻品种的组配选育和推广应用提供理论支持。
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基于ISSR标记的广西桄榔种质资源遗传多样性及亲缘关系分析
《经济林研究 》 2024 北大核心
摘要：【目的】为桄榔种质资源的保护和可持续开发利用提供参考。【方法】采用试剂盒方法，选择健康、新鲜、表现良好的嫩叶，提取广西18个桄榔居群的201份样品基因组DNA，通过ISSR分子标记技术，利用10条清晰明亮、多态性好的ISSR引物对桄榔样品基因组DNA进行PCR扩增。使用POPGENE32软件计算引物的多态性指标，用NTSYS软件中的UPGMA法构建居群间的聚类图，分析评价广西桄榔种质资源遗传多样性与亲缘关系。【结果】10条引物共扩增出150个位点，所有位点均具有多态性，多态性比率为100%，等位基因数量平均值为1.552 2，有效等位基因数量平均值为1.278 6,Shannon’s遗传多样性信息指数平均值为0.257 8,Nei’s基因多样性指数平均值为0.168 1。弄岗居群具有最高的遗传多样性（Nei’s基因多样性指数为0.214 4），南宁市人民公园居群的遗传多样性最低（Nei’s基因多样性指数为0.104 7）。201份供试样本的遗传相似性系数为0.833 8～0.983 2，平均值为0.916 2。其中，崇左市天等县居群与南宁市人民公园居群之间遗传相似性系数最低，遗传差异性最大，亲缘关系最远；龙州县水口镇居群与龙州县武德乡居群之间遗传相似性系数最大，遗传差异性最小，亲缘关系最近。聚类分析结果显示，在遗传相似性系数为0.928时，可将18个居群分成5个类群。【结论】广西桄榔遗传多样性水平较高，ISSR分子标记在桄榔种质间有丰富的多态性，能较好地揭示桄榔居群间的亲缘关系，适用于桄榔遗传多样性研究。
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19个广西审定丝苗型品种主要农艺性状与遗传多样性聚类分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了明确广西审定丝苗型品种的趋同程度与遗传差异,选用19个广西审定丝苗品种,通过18个主要农艺性状表型鉴定与聚类分析,并采用48对SSR标记进行遗传多样性分析.结果表明:基于农艺性状表型的品种间欧氏距离聚类,可分为4类,包含12个品种的类群农艺性状表型表现趋同;3个两系品种,2个常规稻,14个三系品种均被聚类在不同的大类中,说明育种方式不影响表型聚类,农艺性状表型差异多样.基于SSR标记的遗传距离聚类,所有品种可以被划分为4个类群,而不同类群之间的遗传差异也显而易见,遗传多样性丰富;具有相同母本,或采用相同父本的品种,基本归于同类.两种聚类结果的对比表明,育种中品种间会出现遗传关系较远,农艺性状接近的情况;也会出现遗传关系较近,农艺性状相差较远的情况.研究农艺性状表型鉴定与聚类和解析遗传多样性的结果可为广西丝苗型品种的选育和推广保护提供理论和技术支持.
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广西割手密创新种质F1群体的表型多样性分析
《江苏农业科学 》 2024 北大核心
摘要：基于表型性状对60份广西割手密F1群体创新种质材料的遗传多样性进行分析，为广西割手密创新种质材料的利用提供理论依据，以60份含广西割手密87-16血缘F1群体创新种质为材料，通过变异分析、相关分析、主成分分析和聚类分析对其分蘖率、株高、茎径、锤度、有效茎数、单茎重、单产和糖产量等8个主要农艺性状进行遗传多样性分析。结果表明，该群体的8个农艺性状变异较丰富，变异系数在5.51%～36.36%之间，其中单茎重的变异系数最大，达到36.36%;相关性分析表明，单产与株高、茎径、有效茎数和单茎重呈极显著正相关，并与品质性状糖产量也呈极显著正相关；主成分分析表明，2个主成分累计贡献率为75.744%,第1主成分糖产量因子是重要因子，贡献率为52.063%;聚类分析结果表明，在欧氏距离为9.50处将60份创新材料分为5类，分类的5个类群都各具优势和不足，这些性状可以根据不同的甘蔗育种目标而进行充分的利用。其中第Ⅰ类群和第IV类群的8个性状指标均优异，共筛选出12份优质材料，分别是GXSF112-1、GXSF112-27、GXSF112-29、GXSF112-53、GXSF112-14、GXSF112-40、GXSF112-42、GXSF112-63、GXSF112-10、GXSF112-13、GXSF112-21、GXSF112-26,可以进一步作为亲本材料在甘蔗育种中加以利用，也可为割手密种质应用和品种选育提供理论参考。
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茉莉花全基因组SSR标记开发及其亲缘关系鉴定
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：根据茉莉花（Jasminum sambac）全基因组序列进行SSR分子标记开发，分析其SSR位点的组成及特征，并开展40份素馨属（Jasminum）种质的遗传多样性分析及41份茉莉花开放授粉系的亲缘关系鉴定。利用MISA软件对单、双瓣茉莉花全基因组进行SSR位点检索，共检测到140803个，重复基元中共有5种重复类型，以二核苷酸和三核苷酸的重复次数最多，分别为87 785次和46 735次，占SSR总位点数的62.35%和33.19%。挑选单、双瓣茉莉花共有且存在变异的SSR位点，根据单瓣茉莉花的参考基因组，采用Primerv3.0软件成功设计出1847对SSR引物，随机挑选出均匀分布的240对引物，以8个遗传背景差异较大的茉莉花种质混合DNA为模板对其进行扩增，最终确定了14对多态性SSR标记。利用开发的14对SSR标记对40份茉莉花种质进行检测，共发现169个等位基因，平均等位基因数（Na）、有效等位基因（Ne）、Shannon's信息指数（I）、观察杂合度（H_o）和期望杂合度（He）分别为12.1、4.067、1.772、0.505和0.725，多态性信息含量（PIC）介于0.378～0.817之间，均值为0.702。通过UPGMA聚类，在Nei's遗传距离0.82处将40份茉莉花种质划分为3大类群；在遗传距离0.66处，茉莉花和毛茉莉（J.multiflorum）聚为一类。群体结构分析表明40份茉莉花种质可分为3个类群，群体间存在部分种质混杂。利用开发的SSR标记对41份开放授粉系及14份候选父本进行检测，共发现103个等位基因，平均Na、Ne、I、H_o和He分别为7.4、2.446、1.061、0.366和0.522,PIC介于0.159～0.744之间，均值为0.477，有6对引物为高度多态位点；在Nei’s遗传距离0.82处将55份供试材料划分为3大类群，供试茉莉花母本及其开放授粉系全部聚为一类，在遗传距离0.28处2个茉莉花母本分别与其开放授粉系聚在一起。利用Cervusv3.07软件分析SSR位点在开放授粉系和已知母本及候选父本的遗传多样性参数，位点累积排除概率随位点数增加而增大，对于单亲已知类非父本排除概率（NE-2P）,14个位点的累积排除概率高达0.9962；当候选父本、三联体置信度均在95%时，41份开放授粉系中有30份鉴定出父本，其似然对数比值（LOD）均为正值，其中判定为自交子代的有26个，占86.67%，判定为杂交子代的有4个，占13.33%，杂交子代的父本均为泰国双瓣茉莉。
关键词： 茉莉花 SSR分子标记 亲缘鉴定 遗传多样性 全基因组
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