科研产出
野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立
《基因组学与应用生物学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛,已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台,但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪,本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Miseq测序方法。该方法包括:制备分离a型和α型交配型的单倍体菌株、采用电泳和分光光度法方法监控基因组文库建立、优化上机文库浓度后测序。其中电泳和分光光度法方法为首创的文库质量监控简易方法,质控检测得到酿酒酵母工业菌株测序条件为:菌株的基因组文库DNA片段大小为250~850 bp且主要集中在350~550 bp,文库浓度范围为7~13 ng/μL;上机测序文库的优化浓度为20 pM。
关键词： 酿酒酵母 野生型工业菌株 Miseq 基因组测序方法 文库质量
全文链接
请求原文
报道福建武夷山的一种具甲壳沟腹茧蜂
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：游兰韶等于2006年将福建武夷山的一种沟腹茧蜂(Diocogaster sp.)鉴定为拱茧蜂(Fornicia sp.)。2011年,van Achterberg经鉴定认为,此蜂系应属于沟腹茧蜂属(Diolcogaster Ashmead)。沟腹茧蜂属Diocogaster Ashmead,1900的basimacula种团是形态特异类群,武夷山沟腹茧蜂Diolcogaster basimacula种团sp.,特征为前翅第2肘室裂口形,后翅臀叶凹陷无毛,腹部背板甲壳状,T2和T3有明显的中区,两背板之间的横缝深且宽,内有刻条。
全文链接
请求原文
拳卷地钱基因组DNA提取及ISSR-PCR扩增体系优化
《时珍国医国药 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：目的建立一种拳卷地钱基因组DNA的提取方法;对影响拳卷地钱ISSR-PCR反应的各因素进行优化,建立稳定的反应体系。方法采用改进的CTAB法提取拳卷地钱基因组DNA;以Taq酶、Mg2+、dNTP和引物4因素3水平的正交设计对拳卷地钱ISSR-PCR反应体系进行优化。结果采用改进的CTAB法提取的拳卷地钱基因组DNA质量高,且适用于ISSR-PCR扩增;获得拳卷地钱最佳反应体系(20μl)为:Taq酶0.5 U,Mg2+2.0 mmol/L,dNTP 250μmol/L,模板DNA 50ng,引物0.6μmol/L。结论建立并优化了拳卷地钱总DNA提取方法及ISSR-PCR反应体系。
关键词： 拳卷地钱 DNA提取 ISSR-PCR 正交设计 体系优化
全文链接
请求原文
超声波处理种子和基肥施锌对香稻干物质、锌积累特性的影响
《广东农业科学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：为了研究超声波处理种子和基肥施锌对香稻干物质、锌积累特性的影响,以常规香稻品种农香18和美香占为材料进行大田试验,设置锌肥处理和超声波种子处理,测定两香稻品种各生育时期茎、叶、穗的干物质积累量和锌含量等指标。结果表明,在超声波处理种子和基肥施锌处理下,农香18和美香占各器官的干物质积累量、锌含量、锌积累量均显著高于对照。随着生育期的推移,叶锌的含量呈先降低后升高的趋势,在Zn0处理下茎锌的含量先降低后升高,在Zn2和Zn4处理下则呈先升高后降低再升高的趋势。Zn0处理下叶和茎锌含量在分蘖期最高,施锌处理(Zn2、Zn4)下则成熟期最高。结论:(1)超声波处理种子和合适的基施锌肥浓度可以提高香稻的干物质积累量、锌含量和锌积累量;(2)高浓度的锌肥(Zn4)可以提高香稻生育后期吸收锌的能力。
关键词： 香稻 种子处理 超声波 锌肥 干物质积累 锌积累特性
全文链接
请求原文
微生物法合成(R,R)-2,3-丁二醇的研究进展与展望
《基因组学与应用生物学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：2,3-丁二醇是重要的生物基化学品和液体燃料,广泛应用在化工、食品、能源、医药等领域。单一构型的(R,R)-2,3-丁二醇不仅具有混旋型2,3-丁二醇的基本功能,而且在不对称合成方面优势突出,是合成手性试剂和手性配体的重要前体,在高价值手性液晶材料、医药和农药中间体的合成方面具有重要应用。本文全面综述了近年来生物法制备(R,R)-2,3-丁二醇的最新研究成果,总结了多粘类芽孢杆菌合成高光学纯(R,R)-2,3-丁二醇的分子机理、代谢途径、发酵底物和发酵工艺。同时介绍了利用代谢工程技术对天然微生物代谢网络进行重新设计和合理改造,以及利用合成生物学先进技术在模式菌株中重建(R,R)-2,3-丁二醇合成途径等方面所取得的研究进展。综述最后讨论了各种生物法存在的主要问题和重点研究方向,并提出了利用后基因组时代的系统生物学与合成生物学手段,通过合理设计和多途径优化的方法构建高效细胞工厂的指导性建议。
关键词： (R,R)-2,3-丁二醇 手性合成 代谢工程 合成生物学 微生物细胞工厂
全文链接
请求原文
旱稻孢囊线虫在广西的发生及其rDNA-ITS异质性分析
《中国水稻科学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：2011年,从广西龙胜梯田的水稻根系和稻田土壤中分离到一种孢囊线虫。该线虫形态特征与已报道的旱稻孢囊线虫(Heterodera elachista)相符,其rDNA-ITS序列与GenBank中旱稻孢囊线虫的rDNA-ITS序列相似性为97.7%~99.3%。rDNA-ITS分子发育树表明该线虫与旱稻孢囊线虫以100%的置信度及较小的遗传距离形成一个单系,据此将该线虫鉴定为旱稻孢囊线虫。进一步对本研究获得的10条旱稻孢囊线虫rDNA-ITS区序列及Tanha Maafi等报道的1条旱稻孢囊线虫rDNA-ITS序列(AF498391)的酶切位点进行分析,结果发现AluⅠ、AvaⅠ、MvaⅠ和RsaⅠ4个内切酶的酶切位点在11条序列中完全一致,而Bsh1236Ⅰ、BsuRⅠ和CfoⅠ3种酶的酶切位点存在变异,其中Bsh1236Ⅰ和BsuRⅠ有2种变异型,CfoⅠ则有3种变异型,表明旱稻孢囊线虫的rDNA-ITS序列存在DNA异质性。
关键词： 旱稻孢囊线虫 水稻 鉴定 rDNA-ITS 异质性
全文链接
请求原文
甘蔗健康种苗繁育技术研究进展
《生物技术通报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：甘蔗健康种苗系指通过种茎温汤处理或腋芽茎尖培养等方法脱去甘蔗体内病菌的腋芽试管苗或种茎及其无性繁殖种茎苗,以及在不同隔离条件下逐代繁育并符合标准的原原种、原种和生产用甘蔗种苗。在生产甘蔗健康种苗过程中,利用间歇浸没式生物反应器(TIBs)进行甘蔗健康种苗的快繁,提高了增殖系数,降低了工作量。"甘蔗健康种子"的新技术,大大减少了甘蔗种植的用种量,并有利于机械化操作,降低了甘蔗种植成本。
关键词： 甘蔗 健康种苗 间歇浸没式生物反应器(TIBs) 健康种子
全文链接
请求原文
里氏木霉纤维二糖水解酶基因cbh1的分子改造
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】用分子改造的方法改造里氏木霉(Trichoderma reesei)的纤维二糖水解酶基因cbh1,提高其纤维素酶活力,为工业化生产纤维素酶提供参考。【方法】用DNase I消化里氏木霉cbh1,回收100 bp左右的片段后用T4 DNA连接酶连接,以连接产物作为模板进行PCR扩增,将PCR改造的cbh1基因转化里氏木霉原生质体,使改造的cbh1基因与里氏木霉原有的cbh1基因发生同源重组。通过比较滤纸酶活力的方法筛选纤维素酶活力提高的突变菌株,在NCBI上比对分析突变菌株的cbh1序列。【结果】经克隆测序获得基因片段大小为637 bp,与里氏木霉同属菌株cbh1基因的相似性在88%~98%,确定为里氏木霉cbh1的基因片段。经DNase I消化15 min、T4 DNA连接酶连接、经PCR扩增获得改造后的cbh1基因。将改造cbh1基因片段转化里氏木霉原生质体,得到cbh1基因突变体库。从cbh1基因突变体库中筛选获得1株纤维素酶滤纸酶活比出发菌株高1.7518倍的突变菌株E2-1。序列比对分析发现,与出发菌株相比,突变菌株E2-1的cbh1基因有14个碱基发生了突变,其中5个碱基为置换突变,8个碱基为缺失突变,1个碱基为插入突变,分布于cbh1基因的9个位置。【结论】改造后的cbhl基因能与里氏木霉的染色体DNA发生同源重组,进而提高突变菌株的纤维素滤纸酶活力。
关键词： 里氏木霉 纤维素酶 纤维二糖水解酶基因 分子改造 碱基突变
全文链接
请求原文
播种期对晚季香稻香气2-乙酰-1-吡咯啉含量和产量的影响
《生态学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：为了确定华南双季稻区晚季香稻的适宜播种期,在大田条件下以桂香占和农香18为材料,研究了播种期对香稻香气2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)、脯氨酸代谢酶活性和产量的影响。结果表明:(1)7月20日播种的香稻的2-AP含量最高,2-AP含量较高的播期其游离脯氨酸含量、籽粒脯氨酸氧化酶活性以及脯氨酸脱氢酶活性维持在较高水平。(2)7月15日播种的桂香占和7月20日播种的农香18的产量最高,产量较高的播期具有较高的收获指数、干物质积累量和群体生长率。(3)试验条件下晚季香稻的适宜播种期为7月15日-7月20日。
关键词： 香稻 播期 2-乙酰-1-吡咯啉 产量
全文链接
请求原文
