科研产出
芒果DELLA-GAI基因及其启动子的克隆与分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：DELLA蛋白是赤霉素(GA)代谢通路中的受体因子,参与了数种环境信号、激素信号的系统反应.本研究采用同源克隆的手段,参考NCBI登录的'阿方索'芒果的基因组数据,克隆了'贵妃'芒果的DELLA-GAI基因.其全长cDNA序列长2 120 bp,包含一个1 719 bp的开放阅读框(ORF),编码572个氨基酸,蛋白分子量为62.9 kD,等电点为5.10.由系统进化树分析可知,可可、榴莲、番木瓜、木薯等作物与该基因编码的蛋白聚为一类.经互作蛋白分析发现,芒果DELLA-GAI可能与GID1B、GID1C、SLY1、PIF4、JAZ1、GA3OX1等蛋白存在相互作用.启动子结构分析发现,该启动子主要含有MYB响应元件、光响应元件、植物抗病相关元件、MYC响应元件、MYB识别位点以及脱落酸和水杨酸响应元件.通过检测DELLA-GAI基因在'贵妃'芒果果实不同发育阶段的表达情况发现,其在果实成熟期和完全成熟期表达量比较高,而在幼果期的表达量比较低.该基因及其启动子的研究与分析为探究'贵妃'芒果果实色泽及其抗逆境调控机制提供了条件.
关键词： 芒果 DELLA-GAI基因 启动子 基因克隆
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芒果乙烯响应转录因子MiERF113基因的克隆及表达分析
《热带作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：芒果(Mangnifera indica L.)是著名的热带水果,深受消费者的喜爱.我国是世界第二大芒果生产国,其中广西为全国最大的芒果产区.芒果是典型的呼吸跃变型水果,其果实在采摘后因乙烯大量释放容易软化腐烂,导致货架期短,影响产业的发展.乙烯响应转录因子(ethylene response factor,ERF)是乙烯信号通路中的关键基因,参与果实内源乙烯合成的信号转导.为了探究ERF在芒果果实采后成熟调控的作用机制,以'台农1号'芒果为研究对象,依据前期完成的芒果转录组数据结果,筛选并克隆得到1个ERF基因(MiERF113),利用生物信息学方法分析MiERF113的基本理化特征、保守结构域、蛋白质结构、进化关系等;利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术对MiERF113基因在芒果采后不同贮藏时期的特异性表达进行分析.结果表明:MiERF113基因的开放阅读框(ORF)长度为681 bp,编码227个氨基酸,预测蛋白质分子量为25.61 kDa,理论等电点(pI)为6.07,总平均亲水性为-0.883,有32个磷酸化位点,无跨膜螺旋结构,无信号肽.蛋白质结构域预测MiERF113蛋白仅含有1个保守的AP2结构域,且该结构域中第14和19位氨基酸分别为丙氨酸和天冬氨酸,符合ERF亚家族的典型结构特征.将芒果与拟南芥、猕猴桃、阿月浑子、苹果、柑橘和茶树的ERF氨基酸序列进行进化分析,发现MiERF113与阿月浑子ERF113的同源性较高,亲缘关系最近.利用qPCR检测MiERF113基因在芒果采后不同贮藏时间果皮和果肉部位的表达情况,结果显示,MiERF113基因在果皮和果肉中均有表达,且随着果实不断成熟其表达量在逐渐增加,在采后贮藏12 d时表达量达到最高.本研究为揭示MiERF113基因在芒果采后成熟过程中的调控作用提供理论依据.
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CDDP结合SRAP标记分析杧果品种的遗传多样性
《中国南方果树 》 2022 北大核心
摘要：应用CDDP和SRAP分子标记技术对35个杧果品种进行遗传多样性分析，统计遗传多样性信息数据，并进行聚类分析和主成分分析。结果表明，12条CDDP引物和12对SRAP引物组合分别扩增得到条带263条和243条。其中多态性条带数分别为250条和230条，多态性条带比率分别为95.45%和94.61%,有效等位基因数分别为1.59和1.62,Nei’s基因多样性分别为0.32和0.24,Shannon信息指数分别为0.55和0.46,多态性信息含量分别为0.60和0.59,遗传相似系数变化范围分别为0.64～0.96和0.64～0.92,平均遗传相似系数分别为0.80和0.78,CDDP结合SRAP标记遗传相似系数变化范围为0.62～0.94,平均遗传相似系数为0.78。CDDP标记、SRAP标记以及CDDP结合SRAP标记分别在遗传相似系数为0.709 5、0.694 7以及0.685 0处可以将35个杧果品种分别分为3类、3类和5类，说明两种标记结合分析能够更加详细地解释杧果品种间的亲缘关系。而主成分分析结果和聚类分析结果有相似之处，但也有很大不同。
关键词： 杧果 CDDP SRAP 聚类分析 主成分分析 遗传相似系数
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广西右江河谷产地杧果农药残留现状及膳食风险评估
《中国南方果树 》 2022 北大核心
摘要：在广西右江河谷产区采集99份杧果果样，对样品中106种农药残留进行分析检测，分析该地区杧果农药残留现状，并运用概率分别点评估方法对农药残留膳食摄入风险进行评估。结果表明，果样中检出农药类型中，以甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂为主，检出率高达61.62%。检出20种农药残留，检出率为80.80%,2种及以上农药残留检出率67.67%;其中吡唑醚菌酯检出率最高，达到46.46%。按照GB 2763—2021,99份果样中超标果样14份，占比14.14%,其中1份果样吡唑醚菌酯和氯氟氰菊酯均超标。检出农药对成人和儿童的慢性膳食摄入风险（%ADI）在0.00～2.43%之间；其中氯氟氰菊酯、联苯菊酯对儿童的急性膳食摄入风险（%ARfD）分别为101.82%、136.16%,检出农药对成人的急性膳食摄入风险均小于100%。说明广西右江河谷地区杧果多农药组分残留情况明显，吡唑醚菌酯和氯氟氰菊酯需要重点监测关注；儿童从杧果摄入氯氟氰菊酯和联苯菊酯农残的急性膳食有一定风险，成人的杧果农药残留急性和慢性膳食风险极低。
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4种杀虫剂对芒果蓟马的田间防效
《农业研究与应用 》 2021
摘要：为了探究4种常用杀虫剂对芒果蓟马的防效,本研究在百色田阳芒果基地开展不同杀虫剂防治芒果嫩梢蓟马的田间试验。结果表明20%多杀·甲维盐SC 30 g a.i.·hm-2在药后7 d内的防效均在78%以上,防效最佳,其次是6%乙基多杀菌素SC 9 g a.i.·hm-2在药后7 d内的防效在71%以上,20%吡虫啉SLX和25%吡虫·异丙威WP两种浓度处理的防效均在60%以下。因此在芒果蓟马防治上建议将20%多杀·甲维盐和6%乙基多杀菌素与其他杀虫剂轮换使用,同时加强区域统一防治,以提高防效。
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优质杧果新品种桂芒一号的选育
《果树学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：桂芒一号是以紫花芒和金煌芒为亲本杂交育成的中晚熟优质杧果新品种。果实长椭圆形,平均单果质量425.0 g;果肉浅橙色,纤维少,味清甜,有奶香;可溶性固形物含量（w,后同）22.3%,总糖含量19.1 g·100 g-1,总酸含量0.21 g·100 g-1,维生素C含量9.08 mg·100 g-1,可食率78.5%,品质优。该品种生长势较强,两性花比例和坐果率高,4年生树平均株产21.0 kg,折算产量达17 640.0 kg·hm-2,丰产、稳产性好;在广西南宁和桂南地区成熟期为7月下旬至8月中旬,果实生育期110～130 d。采收后熟后室温贮藏期3～5 d。该品种品质优良,适宜在广西杧果产区种植,果实套袋可改善外观。
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芒果叶绿体基因组密码子使用偏好性分析
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：本研究利用CodonW、SPSS、Excel软件对芒果叶绿体基因组55条蛋白编码序列的密码子开展了中性绘图、PR2-plot、 ENC-plot和最优密码子分析。结果表明,芒果叶绿体基因的有效密码子（ENC）偏好性不强,分布在35.38～56.56;GC3s含量26.29%,说明密码子末位碱基以A/T结尾为主;ENC与GC3极显著相关。相对同义密码子分析,RSCU>1的密码子有31个,其中,以A和T结尾的29个,表明A和T是基因组偏爱的密码子。中性绘图、PR2-plot和ENC-plot分析表明,芒果叶绿体基因组密码子使用偏好受突变和选择等因素共同作用的影响。通过高频率密码子和高表达优越密码子相结合的方法进行分析,筛选出主要以A和T结尾的芒果叶绿体基因组最优密码子19个,分别是GCT、TGT、GAA、TTT、GGT、CAT、ATT、AAA、TTA、CCT、CAA、AGA、CGA、CGT、AGT、TCT、ACT、GTA和CTT。
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