科研产出
基于高密度遗传图谱的水稻穗长QTL定位与分析
《华南农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】深入挖掘与穗长相关的新基因，为水稻穗长调控的遗传机理研究及分子育种提供依据。【方法】以2个优良亲本‘ZP37’和‘R8605’及其杂交衍生的208个高世代重组自交系（Recombinant inbred lines,RILs）为作图群体，利用全基因组重测序高密度连锁图谱对3个不同环境下的穗长数量性状座位（Quantitative trait locus,QTL）进行定位，同时分析它们的聚合效应。【结果】共检测到11个穗长QTL，分别分布在第3、4、7、8、9和12号染色体上，其似然函数比对数值（Log of odds,LOD）介于3.07～12.87之间，贡献率在2.17%～10.94%之间，有7个QTL是新位点，其余4个QTL位点与已报道的穗长基因和QTL位置重叠或相近。在2个不同环境下重复检测到4个稳定的QTL位点；对聚合了不同数量穗长QTL株系的分析结果表明，穗长QTL表现出累加效应，QTL数量的增加能显著增加水稻穗长。【结论】本研究结果为水稻穗长QTL的克隆和功能解析奠定坚实的基础，为水稻高产育种提供理论依据和遗传资源。
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澳洲坚果新品种'JW'
《园艺学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：‘JW’是从澳大利亚引入的澳洲坚果实生群体中选育出的新品种。果实卵圆形，横径32.89 mm，纵径41.61mm，平均鲜果质量18.80g，鲜壳果质量9.09g，出种率48.36%，出仁率29.80%；果仁含脂肪73.70%，蛋白质82.80 mg·g-1，总糖24.00 mg·g-1。4年生树鲜果单株产量12.98 kg。
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四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的分离及序列分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶（RT）基因序列，分析了其序列特点和差异，为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物，PCR扩增四倍体野生种花生（Arachis monticola）（PI468199）的DNA，目的条带经回收、克隆和测序后，进行生物信息学分析。结果显示，目的条带大小约为430 bp，共有29条AmRT2-X基因序列被分离出，这些序列长度变化范围为397～433 bp,AT所占比例范围为55.66%～65.97%，核苷酸序列间相似性在45.1%～97.2%之间，存在较高异质性；29条AmRT2-X基因序列被聚类划分为8个家族，家族A是包含序列最多的家族；翻译成氨基酸后，有10条AmRT2-X基因序列发生了无义突变；氨基酸序列间相似性在22.3%～98.6%之间，呈现高度异质性；绝大部分AmRT2-X基因序列的保守基序一致；系统进化树显示，所有RT基因序列被分为6类，其中，Ⅰ类包含20条AmRT2-X基因序列，Ⅱ类中的4条Am RT2-X基因序列与来自拟南芥、多花黑麦草、火龙果、牡丹、果梅、枣、山桑、白皮松等物种的序列之间亲缘关系较近；通过比对花生EST数据库，发现2条具有转录活性的四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子。本研究为Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列的分离及其功能的研究提供一定基础。
关键词： 花生 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 异质性 四倍体野生种
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基于叶片匹配的作物植株图像分离与计数方法
《江苏大学学报(自然科学版) 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要：构建了从连续采集的田间图像中提取作物植株的算法，为图像采集植株微观生长信息提供算法支撑.首先，从图像中分割出叶片，根据叶片距离分离出单个植株；将连续相邻的两幅图像进行拼接获得拼接变换，并将两幅图像中各植株图像与空图像按照获得的拼接变换计算出植株拼接变换图；其次，求出各株拼接变换图的叶片图像质心，采用距离门限的方法判断两植株图像是否为同株作物；在此基础上，采用传递闭包获得各株作物在不同图像中的集合，并用距离中心最小的方法从各株集合中选择出最佳图像，用5种作物对该算法进行验证，结果表明：株数检测准确率达到了100%,提出的方法也成功地将各植株图像精确地提取出来，同时算法显示出高效的计算效率.
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桂糖47号和桂糖31号对机械收获的生理适应性差异
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：当前甘蔗机械收获不能大面积推广的难点和痛点是机械碾压对甘蔗生长造成的负面影响.为了探明机械收获对桂糖47号(GT47)和桂糖31号(GT31)苗期主要农艺性状和重要生理指标的影响,为甘蔗机械收获的生理适应性评价和适宜机械收获品种选育提供理论参考.试验采用随机区组设计,设机械收获和人工收获2种处理,对比分析不同处理的发株率、分蘖率、叶片主要成分、根系活力及相关酶类的差异.结果表明,机械收获对GT31的发株率和分蘖率影响较大,对GT47发株率的影响不明显;2个甘蔗品种人工收获时的含氮量差异极显著,2种收获方式对GT47的含氮量影响不明显;人工收获时,GT47和GT31的全磷含量差异极显著,而机械收获时,2个品种的全磷含量无显著差异.钾含量受不同收获方式和不同甘蔗品种的影响都较大,无论是机械收获还是人工收获,GT47和GT31的全钾含量之间均存在极显著差异;不同收获方式下,不同甘蔗品种的根系活力差异较大,机械收获时,GT47和GT31的根系活力分别为0.53 mg/(g·h)和0.82 mg/(g·h),差异达到极显著水平,而人工收获时,2个品种的根系活力无明显差异;机械收获后,GT31根系的MDA含量在机械收获后极显著高于人工收获,而GT47根系的MDA含量在2种收获方式下无明显差异;机械收获时,GT47根系的CAT活性达到688.07 nmol/(min·g),极显著高于GT31;不同品种间,相同品种的不同收获方式间,根系的Pro含量和POD活性均差异不显著.不同甘蔗品种对不同收获方式的适应性存在差异,GT47在机械碾压后,在发株、分蘖等农艺性状和叶片营养、根系活力、根系抗逆相关酶类等生理指标变化上均表现出对机械碾压更快速和敏锐的反应能力,GT47较GT31更适宜机械收获.
关键词： 桂糖47号 桂糖31号 机械收获 机械碾压 生理适应性
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无核柚新品种宝石红柚的选育
《果树学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：宝石红柚是由越南青柚芽变单株选育而成的新品种。果实梨形，果径长，果面黄绿色、着色均匀、光滑，海绵层为粉红色。平均单果质量1447 g，无核，果肉红色，果心中空。果肉甜脆爽口，水分足，可溶性固形物含量（w，后同）10%～12.5%，总酸含量0.44%，总糖含量6.3%，维生素C含量60.7 mg·100 g-1，可食率59.4%。在广西隆安（107.92 E、23.09 N）成熟期为10月上旬，早结丰产稳产，喜高温，自花结实能力强，5年生树平均株产85 kg，自花，不需配置授粉树，与酸柚砧木嫁接亲和性好，幼年树生长较快，树姿较直立，分枝力强，弱枝为主要结果母枝。在生产中要注意防控溃疡病和柑橘褪绿矮缩病，对微量元素镁需求量较高。适宜在广西北回归线以南的桂中、桂南地区种植。采摘期较短，留树久会出现油胞干水粒化现象。
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基于SSR荧光标记的广西天冬种质资源遗传多样性分析
《种子 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为充分利用天门冬种质资源,采用荧光 SSR分子标记毛细管电泳技术,对广西及其周边不同生态环境的 25 份天门冬材料进行了遗传多样性分析.结果表明,从 24 对引物中筛选出 8 对位点多态性高且重复性好的引物,共扩增出33 个多态性位点,平均每对引物扩增 4.1 个,每个引物扩增多态位点在 2~10 之间,多态性位点百分率为 68.75%;材料间遗传相似系数为 0.084~1.00,平均值为 0.44.聚类分析结果表明,25 份天门冬材料可分为两个大类,不同来源地的天冬资源穿插分布,地理分化不明显.荧光 SSR分子标记毛细管电泳技术适合分析天门冬的遗传多样性,广西天冬具有较丰富的遗传多样性,来自隆林的 16 号野生资源与多个材料的遗传差异较大.
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澳洲坚果种质果实数量性状分析与综合评价
《植物遗传资源学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以100份澳洲坚果种质为研究材料，通过相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法对12个果实数量性状进行综合评价分析。结果表明：12个数量性状变异系数介于9.66%～23.62%，单果重和果仁重的变异程度较大。相关性分析表明单果重与果仁重呈极显著正相关，是选育大果的重要参考。聚类分析分为2大类，Ⅰ类果实外观品质较差：果小、出种率与出仁率相对低，属于育苗种质资源类型；Ⅱ类果实实外观品质较好：果大、出种率与出仁率较高，符合市场及选育需求。主成分分析把12个果实数量性状分为4个主成分，累计贡献率为79.902%。主成分1特征值最大，为4.280，贡献率最高，为35.667%，主要与果实外观性状大小有关；主成分2的贡献率为20.177%，主要反映了果仁性状；主成分3的贡献率为13.026%，主要反映了出种率；主成分4的贡献率为11.032%，主要反映了出仁率。果实性状综合评价得分为-2.333～0.983，筛选出综合性状前10的优异种质：花纹、SS14、壮圆1号、临沧47号、桂热1号、南亚2号、A4、B2、临沧1号、贵3；并筛选出单果重最大的FS3、果仁最重的桂热1号、出种率最高的选育8号、出仁率最高的A4。通过这些综合评价数据及筛选出的种质，为后期选育或杂交提供重要参考。
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基于转录组测序的辅助鉴定南方大豆皱叶症分子标记开发
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】基于转录组测序（RNA-Seq）开发辅助鉴定南方大豆皱叶症（SSCLD）的分子标记，为快速鉴定生产上遇到的大豆皱叶是否为SSCLD提供技术支撑。【方法】利用转录组测序技术分析遗传背景相近的皱叶大豆和正常叶大豆材料在皱叶症诱导环境下的差异表达基因（DEGs），从中去除核苷酸序列高度相似的同源序列，筛选出表达差异较大的DEGs进行分子标记开发，利用皱叶大豆材料和逆境处理试验评价分子标记的表达专一性，并利用不同类型的皱叶表型样本对分子标记进行表达专一性及可靠性验证。【结果】7株皱叶植株样本和5株正常叶植株样本的测序碱基错误率为0.0226～0.0238,Q20和Q30分别在99.00%和99.90%以上的碱基数量占总碱基数量均大于95.00%,GC含量为45.60%～46.24%，表明转录组测序数据质量较好。皱叶大豆材料较正常叶大豆材料有1063个DEGs上调表达，85个DEGs下调表达。根据基因的表达量和同源性，共筛选8个DEGs用作开发分子标记的候选基因，均表现为明显上调表达。8个候选基因的实时荧光定量PCR检测结果与转录组数据基本相符。此外，所筛选基因中有6个基因表达在不同程度上受干旱、水渍、冷害、荫蔽和盐胁迫等逆境胁迫诱导，其中，种植于皱叶症土壤中的皱叶型株系叶片GLYMA＿18G033400基因的相对表达量均高于其在正常土壤中受干旱、水渍、冷害、荫蔽和盐等逆境胁迫后的相对表达量。根据GLYMA＿18G033400基因序列设计分子标记qCL-18G033400，并用该分子标记对19份不同皱叶类型的叶片样品进行实时荧光定量PCR检测，结果发现，以ΔCt值小于10.00作为SSCLD的判定标准，分子标记鉴定结果同田间鉴定结果一致。【结论】利用转录组测序技术开发的分子标记qCL-18G033400可辅助鉴定SSCLD。
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